（一）皮毛呼吸到呼吸腮
图1-3-1 软体动物腮呼吸结构示意图
软体动物是由环节动物演化而来，朝着不很活动的生活方式较早分化出来的一支。身体柔软，大多数具有贝壳。身体柔软，一般左右对称，不分节可分为头、足、内脏团三个部分，体被外套膜，常常分泌有贝壳。次生体腔，后肾管，螺旋式卵裂，个体发育中具有担轮幼虫。鳃或肺呼吸。
软体动物身体背部皮肤皱褶向腹面延伸面形成的一种保护器官，由内、外表皮、中间的结缔组织和少数肌肉纤维组成。外套膜与内脏之间有外套腔，外套腔内有鳃和口、肛门、肾脏、生殖腺的开口。外套膜的边缘构造很复杂，常具各种形状的触手，有的种类有外套眼。外套膜内表皮细胞具纤毛，纤毛摆动，造成水流，使水循环于外套腔内，借以完成呼吸、排泄、摄食等。
软体动物体表呼吸几乎完全退化，发育出围心腔、生殖腺内腔、排泄器内腔三个腔体，呼吸器官“腮”结构与心脏和肾脏分布于三个腔体内，有脉管相连，间介中胚层和脏壁中胚层已经分化发育，说明三个胚层已经在体腔内汇集，皮肤呼吸功能基本退化完毕，皮肤神经迁移集中于腹部形成腹索中枢神经结构。（见图1-3-1）
（二）皮腮-呼吸树
图1-3-2过皮鳃的切面示意图
图1-3-3 呼吸树结构示意图
棘皮动物门是一类后口动物，在无脊椎动物中进化地位很高。它们在形态结构与发生上都有一些独特之处，与原口动物有很大不同。外观差别很大，有星状、球状、圆筒状和花状。成体五放辐射对称，由管足排列表现出来。身体区分为有管足的辐部或步带和无管足的间辐部或间步带。内部器官，包括水管系、神经系、血系和生殖系均为辐射对称，只有消化道除外。身体有口面和反口面之分。骨骼很发达，由许多分开的碳酸钙骨板构成，各板均由一单晶的方解石组成。多为雌雄异体，生殖细胞释放到海水中受精，幼体在初发生时形状相同，以后则随纲而异，少数种类可行无性裂体繁殖。对水质污染很敏感，再生力一般很强。摄食方式为吞食性、滤食性和肉食性。
海星和蛇尾的消化系有一大囊状胃，肠直走，不弯曲；海星常有从胃向各腕伸出的一对称为幽门盲囊的消化腺。其他各纲的消化管多为一长而弯曲的管子，由肠系膜连于体壁。蛇尾和某些海星无肛门，凡是不能消化的东西从口里吐出。海百合的口和肛门全朝上，许多歪形海胆肛门常在体后部或口面。没有明显的排泄器官，排泄功能由变形游走细胞负责。呼吸系也不发达。海星的皮鳃(见图1-3-2)和海胆的围口鳃可增加呼吸的能力和面积。某些海参有特殊的呼吸器官，称呼吸树（见图1-3-3）。
棘皮动物门呼吸系统出现两种呼吸结构，皮腮结构时原始皮毛呼吸演变的产物，而呼吸树的出现意义很大，说明内胚层肺分化支已经开始分化发育。
动物从半消化管到完整消化管演变过程中，出现三个内胚层分化支，首先是随着消化管后移分化发育外胚层内移形成的内胚层肺分化支；第二是原肠后端向体腔内分化的内胚层肝脏分化支；第三是排泄孔内陷形成的内胚层膀胱分化支。到棘皮动物门虽然内脏器官还都是内脏团，但是三条内胚层分化支发育出了内脏器官的原基结构，说明已经在向内脏系统演化。
虽然棘皮动物门还有皮表呼吸的皮腮器官存在，呼吸树结构非常类似高等动物的肺结构，这种体内呼吸器官的出现意味着呼吸功能已经内迁到体内，意味着皮表呼吸退化就要结束了。
（三）气管-书肺
