4.中国科学院上海分院
- 上海分院是中国科学院的派出机构，负责联系和管理中国科学院在上海、浙江、福建地区的研究院所工作。
- 上海分院系统有13个国家重点实验室、39个中科院重点实验室，以及中科院上海教育基地、中科院上海国家技术转移中心、中科院上海交叉学科研究中心。
- 上海分院现有一支13718人的科研、管理和支撑队伍，其中专业技术人员9761人，所占比例71.15%，其中高级研究人员4087人。目前拥有的高端人才队伍中，有中国科学院院士54人，中国工程院院士15人。
5.中国科学院南京分院
- 中国科学院南京分院是中国科学院的派出机构，负责联络和协调中国科学院在江苏地区的研究所，协助做好各单位领导干部队伍建设，指导属地研究所党建、纪检和监察工作，负责江苏、江西两省的院地合作和中科院院士联络。
- 南京分院系统拥有国家重点实验室3个、国家工程实验室2个、部委综合实验室1个，中科院重点实验室11个（含筹）。建有野外工作台站15个，其中国家重点台站4个。
- 南京分院系统各研究所设有硕士学位培养专业点39个、博士学位培养专业点24个。2019年在读研究生2146名，其中硕士生1213名、博士生909名、留学生24人，在站博士后160人。
6.中国科学院武汉分院
- 中国科学院武汉分院筹建于1956年，1958年7月正式成立。1961年与广州分院合并成立中国科学院中南分院，武汉分院调整为中国科学院中南分院武汉办事处，1970年该办事处撤销。1978年，经国务院批准恢复中国科学院武汉分院建制。
- 武汉分院各研究所以基础研究、应用研究为主。其主要研究领域包括岩土力学工程、地层信息系统、地基工程、波谱与原子分子、电离层、原子频标、数学物理、普通病毒学、生物防治、分析生物技术、大地测量、地球物理、环境科学、水生态环境、水生生物资源、淡水渔业、植物资源保护与开发利用、植物遗传、水生植物等。
- 武汉分院系统各研究所现有硕士学位授权点25个，博士学位授权点15个，博士后工作流动站6个，硕士生导师260余人，博士生导师160余人。
7.中国科学院广州分院
- 中科院广州分院于1956年筹建，1958年12月成立。1961年广州分院与武汉分院合并成立中南分院。1969年中南分院撤销。1978年5月恢复广州分院。
- 广州分院为中科院机关派出机构，联系中科院在广东的南海海洋研究所、华南植物园、广州能源研究所、广州地球化学研究所、广州生物医药与健康研究院、深圳先进技术研究院、广州化学有限公司、广州电子技术有限公司，在湖南的亚热带农业生态研究所，在海南的深海科学与工程研究所。
- 广州分院拥有国家级和省部级重点实验室(工程实验室)44个，其中，国家重点实验室4个（1个为合作建设）、国家工程实验室2个（1个为合作建设），国家地方联合工程实验室4个（1个为合作建设）、中科院重点实验室14个、省级重点实验室20个、省级工程实验室2个。
- 广州分院拥有博士学位培养点39个，硕士学位培养点52个，专业硕士点20个，博士后科研流动站8个，博士后科研工作站2个。
