从1530年开始到1798年拿破仑入侵马耳他，马耳他骑士团统治了马耳他268年，期间对这个小国历史有着极深刻的影响。这个骑士之国，在现代欧洲是骑士的象征，而首都瓦莱塔，更是以圣约翰骑士团定居马耳他后第六任首领瓦莱塔Jallette(1557—1568在位）的名字命名，因为在1565年马耳他遭到奥斯曼帝国苏莱曼大帝亲自率领4万大军围困时，正是在瓦莱塔领导下，6000名骑士们誓死保卫马耳他，双方发生了激烈的战斗，这一战役就是被法国哲学家伏尔泰认为“没有比马耳他大围攻更著名的战役”的欧洲历史上有名的“马耳他之围”，而付出重大牺牲赢得最后胜利的马耳他骑士团，则荣获了“欧洲之盾”的美誉。
战后骑士团大首领瓦莱塔下令重建被战争打得稀巴烂的马耳他首都，并从原首都比尔古易地重建，免遭奥斯曼帝国铁蹄践踏的欧洲基督教各国，纷纷伸出援手，提供了大量的资金和技术，帮助马耳他首都的重建，当时的教皇庇护五世，则派出了文艺复兴时期著名的建筑师、意大利人佛朗西斯科.拉帕莱利担任新首都的设计师，这位设计师不但是教皇的首席设计师，而且是大名鼎鼎的文艺复兴三巨匠之一的米开朗基罗的助手。
