M2A插槽与SATA0接口复用，也就是说如果安装M.2接口SATA协议的固态硬盘，SATA0接口就不能同时再安装SATA固态硬盘了。如果安装PCIE NVMe固态硬盘则不会产生冲突。
最靠近CPU位置的M2M插槽自带了散热片，它与SATA4、SATA5接口复用，不管在这里安装SATA协议还是NVMe协议的固态硬盘，都会导致2个SATA接口不能使用。
如上面所说，M.2固态硬盘分为SATA与NVMe协议，前者可以认为是普通2.5寸SATA固态硬盘的缩小版，不管速度还是价格都比较接近，后者则是当前最先进的固态硬盘类型，不仅连续读写速度更快，随机访问性能更强，数据传输延迟也比SATA固态硬盘更低。当然NVMe的发热量会比SATA要高出不少，更需要完善的散热降温措施。
上图从上到下分别是东芝饥饿鲨RD400（NVMe协议）、东芝Q200EX M.2（SATA协议）、东芝RC100（NVMe协议），从接口样式上并不能一眼区分出来。如果电脑中安装的SATA固态硬盘较多，RD400和RC100首选M2P插槽，这样不会减少可用的SATA接口数量。但是M2P插槽是没有自带散热片的，所以这里最适合安装低功耗发热小的东芝RC100。
其他情况下，配有散热片的M2M插槽是NVMe固态硬盘的首选，不过需要注意的是如果CPU散热器体积较大的话，M.2固态硬盘安装起来会有一些困难。如果是新装机的话建议先安装固态硬盘后上CPU散热器。
