保护区分为核心区、缓冲区和实验区。
核心区面积183.76平方公里，占保护区总面积的76.08%，该区为海三棱藨草植被集中分布区域，为保护区目前保存较为完好的自然生态系统，是主要保护对象的集中分布区域。一般情况下，该区禁止任何单位和个人进入，但因科学研究的需要，经批准后可以进入，从事科学研究观测、调查活动。
缓冲区面积10.07平方公里，占保护区总面积的4.17%，该区为核心区以外主要保护对象相对集中分布的区域，为核心区外划定的严格保护区域。该区经批准后，可以从事非破坏性的科学研究、教学实习和标本采集活动。
实验区面积47.72平方公里，占保护区总面积的19.75%，该区可以从事科学试验、教学实习、参观考察、旅游以及驯化、繁殖珍稀、濒危野生动植物等活动。
为何会有出入？
其实不仅是教材上不准确，在百度百科上，“上海崇明东滩鸟类国家级自然保护区”词条显示，该保护区的面积约32600公顷，即326平方公里，同样与官方信息有出入。
对于这些信息的出入，崇明东滩自然保护区管理事务中心主任钮栋梁表示，326平方公里是崇明东滩国际重要湿地的面积，而非崇明东滩鸟类国家级自然保护区的面积（241.55平方公里），这是两个概念，应当准确区分。
他说，“我们发现信息有出入的教材是2017年的版本，引用的数据在2020年后没有及时更新。相关网络百科上的信息应该也是未及时更新所致。”
目前，上海绿化市容部门及保护区管理事务中心准备与有关部门、单位沟通此事，希望尽快调整相关内容，毕竟教材和网络百科会影响很多人，应当与时俱进、更加准确。
去年还有上海二年级学生
指出美术教材错误
去年开学时
出生于2013年的吴叶凡
拿到二年级第二学期的美术教材时
看到第13页右上角
引用了一幅很眼熟的图片
虽然教材中的文字标注为
“《树叶》现代陶艺作品”
但吴叶凡看到却很疑惑
“这不是自然博物馆里的
海百合化石吗？”
发现问题的第二天
吴爸爸就带着吴叶凡
前往上海自然博物馆求证
上海自然博物馆工作人员
冷玲证实
沪教版二年级美术教科书上的“现代树叶”
确实是数亿年前的古生物“海百合”
海百合图片和美术书配图对比(左：海百合化石 右：教材中图片 )
吴叶凡的发现，也得到了上海教育出版社的回应。上海教育出版社相关负责人给她赠送了书籍，并对她能指出书中错误表示感谢，第一时间将错误进行溯源并上报修订。
沪教版英语教材出错！小生物迷纠错！
无独有偶，预习沪教版英语教材的12岁学生小崔也发现了教材上的错误。
来自沈阳的他从小就是个生物迷。而他在英语书上发现单词“Bee”上面的图片并不是蜜蜂，而是食蚜蝇！
