它还是当地最主要的淡水资源之一。有大量的清洁水供应，其水量估计为400立方千米。据科学家称，沼泽中至少有 800多个湖泊，但它们大多位于瓦休甘沼泽的北部。额尔齐斯河和鄂毕河的大型支流 -- 瓦休甘河、帕拉贝尔河、查亚河、谢加尔卡河、乌姆河、塔拉河、什什河、塔拉斯河的大支流均源自这片沼泽。
瓦休甘沼泽是一个独特的天然复合物湿地系统，有着极致惊人的景观结构与特殊类型的沼泽地貌，是地球上独一无二的自然景观。它也被称为“俄罗斯的亚马逊”，沼泽南部拥有大片云杉、冷杉、松、桦等常绿和落叶树木森林，是一些濒危物种的栖息地，哪怕在严寒的冬季，这里依旧生机盎然。
沼泽南部是一望无际的巴拉宾草原，上面“撒”满了小红莓、黄莓和越桔。科学家在这里的洼地发现了羊胡子苔草、泥炭藓、和水灰藓等122种野生苔藓植物。这些苔藓和地衣可以净化污水和土层，又能吸收锌、铜和银和其他一些重金属离子。
瓦休甘沼泽内河流湖泊密布，大大小小的湖泊约有800多个，占总面积的48％。在森林和草地之间附近的湖泊和河流中，栖息着许许多多当地的动物，其中不乏珍稀危动物。
