整个博物馆有数十件镇馆之宝，数千件珍稀名贵、存世经典的崖柏、黄花梨、乌木、孔雀石、景泰蓝工艺精品，件件精妙绝伦、鬼斧神工，件件栩栩如生、巧夺天工，件件都蕴藏着一个段不朽的传说，件件都流传着一段美好的神话，件件都吟唱着一首首美丽的诗篇
飞龙在天是红博城博物馆的一件镇馆之宝，重约82.5公斤，估值达3.8亿，是一根古老的崖柏。崖柏起源于恐龙时代，被称为世界上最古老的裸子相物，是世界上仅存的植物活化石。其木材化石始于侏罗纪中期，在白垩纪曾有过鼎盛时期，这条飞龙在天的造型如同一条遨游天际的游龙（影子尤其像，见第四图），所以被命名为飞龙在天，如此厚重的崖柏，必然是大自然的鬼斧神工，加上它香气沁人心脾，放在室内还可净化空气，无愧红博城几大镇馆之宝之一。
至尊宝座，是这座博物馆的另一件镇馆之宝，据专家评估仅材料的价格就超过9.5亿。这套至尊宝座一共13件，所用的材料全是十分稀少罕见的、4100-4150年前被埋藏于地下的米仔兰乌木，按照专家鉴定，打造这套家具的乌木材料，每公斤价值超万元，成材率不到1%，而此物成品净重950KG，所需的原材料约为95000KG，若按原材料的价格估算，95000KG*10000元/KG=9.5亿元，这还只是材料的价值，如果加上这套家具的雕刻艺术、科研考古等方面，那么这套珍宝更是价值连城，不可估量。
黄花梨原木，全长3.3米，直径0.68米，重约435公斤，黄花梨是现今世界上最昂贵的木头之一，有木中黄金之称，属于国家一级保护树种，根据考古资料推测，中国黎族先民早在距今3000年前，就认识并开始使用黄花梨来盖房、制作生产工具及生活用具，早在1000年前的唐代，黄花梨开始被宫廷征用，虽然漫长历史已经远去，但黄花梨的价值却越来珍贵，作为五大名木之一，价格居高不下，2016年海南黄花梨的身价已经达到6万元一公斤，目前黄花梨本身资源已枯竭稀缺，像这样巨大尺寸的黄花梨更是世所罕见，所以有专家评估，这段黄花梨原木的价值高达3.8亿（这些价格都是博物馆上有标记，并非渝帆杜撰）。
