山楂丸与山药丸
前者消食化滞、健胃和中;用于食积、肉积、停滞不化、痞满腹胀、饮食减少等。后者祛风通络、强筋壮骨;用于痹症、筋骨痿软、关节不利、跌打损伤、瘀血作痛等。
二陈丸与二至丸
前者燥湿化痰、理气和胃;用于咳嗽痰多、胸脘胀闷、恶心呕吐等。后者补益肝肾、滋阴止血;用于肝肾阴虚、眩晕耳鸣、咽干鼻燥、腰膝酸痛、月经量多等。
三妙丸与四妙丸
前者燥湿清热、消肿止痛;用于湿热下注引起的湿热痹病，症见足膝红肿热痛、脚气肿痛、湿热带下、阴部瘙痒、小便短赤等。后者清热利湿、通筋利痹：用于湿热下注所致的痹病，症见两足麻木、下肢痿软、筋骨酸痛、足胫湿疹之痒痛等。
五子丸与五仁丸
前者温固下元、运阳补肾;用于肾虚腰痛，尿后余沥，遗精早泄，阳痿不育等。后者生津养液，润燥通便，适用于胃肠津液不足所致的大便干结及习惯性便秘等。
清音丸与清宁丸
前者清热利咽、生津润燥：用于肺热津亏、咽喉不利、口舌干燥、声哑失音等。后者清热泻火、消肿通便;用于火毒内蕴所致的咽喉肿痛、口舌生疮、头晕耳呜、目赤牙痛、腹中胀满、大便秘结、小便黄赤等。
八珍颗粒与八正颗粒
前者补气、益血;用于气血两虚、面色萎黄、食欲不振、四肢乏力、月经过多等。后者清热、利尿、通淋。用于湿热下注、小便短赤、淋沥涩痛、癃闭不通、肾盂肾炎、前列腺炎、口燥咽干、产后及术后尿潴留等。
小金丹与大金丹
前者辛温通络、散结活血;用于疮疽瘰疠、乳疮痈肿、无名肿毒、阴疽初起、痈肿疼痛等。大金丹化痰顺气、定喘止嗽;用于卒然中风、痰壅气闭、神昏不语、胸膈不利、头眩耳鸣、哮喘咳嗽等。
清热丸与清眩丸
前者清热解毒、凉血祛暑、散瘀消肿：用于急热惊风、中暑头昏、吐血衄血、咽喉肿痛、口舌生疮、牙齿疼痛、大小便不通、小便赤黄等。后者散风清热;用于风热头晕目眩、偏正头痛、鼻塞牙痛等。
保和丸和保济丸
前者消食、导滞、和胃;用于食积停滞、脘腹胀满、暖腐吞酸、恶食呃逆、或大便泄泻、舌苔厚腻、脉滑等。后者解表、祛湿、和中;用于暑湿感冒(症见发热头痛、腹痛腹泻、恶心呕吐、肠胃不适)，亦可用于晕车晕船等。
舒筋活络丸与舒筋活血丸
前者驱风祛湿、舒筋活络;用于一般骨节风痛、腰膝酸痛等。后者舒筋通络、活血止痛;用于跌打损伤、闪腰岔气、筋断骨折、瘀血肿痛及风湿性关节炎、类风湿性关节炎等。
人参健脾丸与人参归脾丸
前者健脾益气、和胃止泻;用于脾胃虚弱所致的饮食不化、脘闷嘈杂、恶心呕吐、腹痛便溏、不思饮食、体弱倦怠等。后者益气补血、健脾养心：用于心脾两虚、气血不足所致的心悸、失眠健忘、食少体倦、面色萎黄等。
桑麻丸与天麻丸
前者滋养肝肾、祛风明目;用于肝肾不足、头晕眼花、视物不清、迎风流泪等。后者祛风除湿、通络止痛、补益肝肾;用于风湿瘀阻、肝肾不足所致的头痛眩晕、肢体拘挛、手足麻木、腰腿痠痛等。
