然而，最近业内的种种声音和证据显示，A2奶粉可能有些名不副实了。
首先，A2蛋白能避免乳糖不耐受的功效是否属实一直存在争议。
据了解，近期在A2公司的宣传中，常用一份名为《牛奶β-酪蛋白变异体对中国成年人牛奶不耐受症状的影响》的研究报告作为背书，其研究结果之一就是“含有A2蛋白的牛奶能显著抑制牛奶不耐受的急性胃肠道症状”。
但研究参与者之一，中国疾控中心营养与健康研究所研究员、中国营养学会理事长杨月欣近期接受媒体采访时表示，研究团队对实验设计和结论都比较慎重，“但没想到后期会有这么多广告”。她认为，“一个是科学，一个是广告，这是两回事”，企业发布任何广告都不会经专家审核，而企业存在的问题可能是“广告太过分”或“过早地使用了这个科学”。
另一名参与者，中山大学公共健康学院营养系主任蒋卓勤也认为，上述关于A2型蛋白的实验结果还需要更多佐证，尚无法得出肯定结论。
其次，有迹象表明，A2奶粉并不稀奇。目前已有许多乳企开始布局A2牛奶市场。
2017年6月，三元食品通过奶牛血统追溯及基因筛查体系，推出了只含有A2蛋白的纯牛奶产品，被认为终结了a2公司独占A2奶源的历史；
2018年1月，蒙牛推出A2蛋白儿童牛奶，并称奶源来自于蒙牛专属牧场的“2000头珍贵奶牛”；
2018年3月，惠氏在上海也推出了含有A2蛋白的启赋Atwo（天赋蕴淳）系列奶粉。
乳业专家宋亮认为，所谓的A2型蛋白并非A2公司所宣称的“稀缺资源”。事实上，水牛奶、牦牛奶、山羊奶、绵羊奶都是A2型蛋白奶，即便自然繁育的荷斯坦奶牛中也有30%是纯A2蛋白牛，且基因筛选A2蛋白牛并非难事。
