光量子照射在光合色素上
中心色素包括光能转换色素分子、电子受体和电子供体。
当中心色素的光能转换色素分子被光子激活后，其会释放电子给电子受体，而自身带正电荷（处于氧化态），而电子受体带负电荷成还原态。
随后，光能转换色素分子会从周围的电子供体摄取电子，成为还原态。
如此，当氧化-还原反应不断地进行，电子就在一个个受体、供体间进行了传递，直到传递给最终的电子供体。
我们常见的能够释放氧气的光合作用系统中，都具有长波光系统（PSⅠ）和短波光系统（PSⅡ）两个光系统。
光系统Ⅰ（PSⅠ）能被波长700 nm的光激发，又称P700；光系统Ⅱ（PSⅡ）吸收高峰为波长680 nm处，又称P680。
PSⅠ和PSⅡ承担着电子传递和氢离子（质子）传递任务。
当电子到达PSⅡ系统时，PSⅡ上的放氧复合体(oxgen-evolving complex)会将一分子水分解为两分子氢离子和一分子氧气。
当电子达到质体醌（PQ）通过循环机制，又在类囊体内释放一个氢离子。
如此，就在类囊体的两侧建立氢离子浓度差（内高-外低）。
细胞色素b6f复合体将质子醌中的电子又传给质体蓝素（PC），而后者又将电子传递给PSⅠ。
而PSⅠ又经过一系列流程，最终将电子交给铁氧还蛋白（Fd），而电子最终在还原酶的处找到自己的归宿。
但是，电子在传递链上走了一趟以后，原本类囊体内外的氢离子浓度是一致的，而现在变成囊内氢离子浓度高于囊外。
而在囊膜上，有一种叫做ATP合成酶的特殊结构蛋白。
它上面有氢离子通道，当氢离子因为浓度差，而流向类囊体膜外时，它可合成ATP。
