故事设定在假想的未来。
人类在南极大陆的一次实验失误，引发了一场席卷全球的浩劫，地球生态巨变，这次浩劫被称为“第二次冲击”。
主角生活的2015年，地球上出现了一种巨大机械战斗群入侵者，人们将之称为“使徒”，它们是被“第二次冲击”给惊醒的。
人们研究出一种以驾驶员的神经直接控制的机甲，它们被称为EVA，用以迎战“使徒”。
但是实际上，“使徒”、EVA、驾驶员（适格者）却并不像看上去的那么简单，而组织NERV和SEELE另有一些关于人类起源与进化的重要秘密。
（经典的NERV徽标）
单看简介，可能会觉得《EVA》也不过如此——这就是很普通的“开机甲打怪兽”的套路嘛！
但是，这正是《EVA》系列有趣的地方。调侃的说：一开始观众会觉得它是一部热血机战动画，之后会感觉它其实是玄学奇幻动画，直到最后才能够发现它竟然是一部情感动画....
（最典型的就是当年的大陆引进版，翻译成《新世纪天鹰战士》并做了大量删节....“勇敢的少年啊快去创造奇迹！”）
为什么这么说呢？
首先，《EVA》系列给人的第一印象，就是热血澎湃的战斗场景，充满个性和力量感的巨大机器人，主角在对抗强大敌人的时候获得成长....似乎和其它动画相仿：
（不同版本中，经典的主角机体——“初号机”形象。）
但随后，作品却看似突兀得引入了一些奇怪的神秘学元素：卡巴拉生命之树、亚当与莉莉丝、死海文书、魂之座以及标题中机体本身的名字“Evangelion”（意为“福音书”）
这种“故弄玄虚”在当时是极为超前的，瞬间让《EVA》的格调拉开了同时代的其它类似作品好几个身位；同时，在演绎有关神秘学的片段时，监督（即动画导演）庵野秀明也可以大胆的加入自己所钟爱的意识流画面，让这些片段有很高的美学价值：
