天武天皇棺材与持统天皇骨灰壶的复原
另外，当时被盗掘后不久，墓室的内部状况被写进了《阿不幾乃山陵記》，文章来自当时盗陵后的调查记录，书里说墓室由玛瑙建成，棺材使用了乾漆造。
书里还记载了天武天皇的遗骨状态
御骨的头比普通的头要大，呈赤黑色。胫骨长53厘米（一尺六寸），肘骨长46厘米（一尺四寸）。御棺中残留有少量已经腐朽的红色御衣碎片。
现代学者据此推测天武天皇的身高是175厘米，在当时算很高了。
两年后，盗天武·持统合葬陵的盗墓贼被抓住了，被押送到京都，在官衙门前示众。《百錬抄》是这样记载当时的情形
犯人被押送到大理门前时，来了很多看热闹的车，把路堵住了，非常壮观
之后过了58年，到了1293年，据权大纳言·正亲町三条实躬（藤原实躬）在他的日记《実躬卿記》里的记载。天武·持统合葬陵又被盗掘了，行广法师盗掘了皇陵，将天武天皇的头盖骨盗走了。
另外，植野浩三在他的著作《盗掘された天皇陵の実態》说据江户时代的记录，天武·持统合葬陵的石门处于大开状态，可见13世纪以降就有很多人来盗掘过了。
江户时代，1793年，十一代将军德川家齐执政时期，刊行了一本书《大和名所図絵》（奈良名胜图鉴），里面描绘了游客来天武·持统合葬陵游玩时，自由出入墓室参观的情景。（都成旅游名地了…… 幕府说好的修陵呢……）
《大和名所図絵》里的天武·持统合葬陵内部图
以下是其他的皇陵盗掘状态：
平安·1060年：推古天皇陵被盗。—《扶桑略記》、《盗掘された天皇陵の実態》
平安·1063年：奈良兴福寺的静范和尚与其他人共16人，盗进了成务天皇陵，偷盗了宝物。后来被发现，宝物被归还皇陵，犯人们被流放。—《扶桑略記》、《百錬抄》、《盗掘された天皇陵の実態》
平安·1149年：圣武天皇陵里的石头被取出。—《盗掘された天皇陵の実態》
镰仓·1274年：桓武天皇陵被盗。—《盗掘された天皇陵の実態》
镰仓·1288年：盗继体天皇陵的犯人被逮捕。—《盗掘された天皇陵の実態》
江户·家纲执政时期：郡山藩的平民在成务天皇陵采石，发现了石棺，在里面发现了剑、镜等宝物，藩主本多政胜知道后，发现是天皇陵，就命人将皇陵修复。—《和泉巡覽記》、《盗掘された天皇陵の実態》
江户·家宣、家继执政时期：朱子学者·政治家新井白石在一份文书里这样写道：“仁德（仁德天皇）的鸟野御陵的石棺的盖板石，成了堺的政所的庭院踏石”。—《盗掘された天皇陵の実態》
江户·1848年：嘉兵卫等四个平民盗陵，从石棺缝隙里盗出了管玉68枚。他们在四年前也盗过的，当时偷盗了勾玉50枚，一部分被换成金钱。据1853年的调书，盗掘犯团伙在判决前死了三人，剩下的一人在七年后的1860年被押送到奈良，处于磔刑。—《盗掘された天皇陵の実態》
明治·1872年：仁德天皇陵被自然灾难破坏，有人怀疑其实是身为堺县令的税所笃盗掘了天皇陵。—《盗掘された天皇陵の実態》
大正·1915年：一个八人的盗墓团伙盗了狭木之寺间陵（垂仁天皇的皇后日叶酢嫒命的陵），盜走几十件文物，后被逮捕，判了十三年有期徒刑。—《盗掘された天皇陵の実態》
昭和·1986年，几个考古专业的大学生，盗进了位于大阪府堺市的履中天皇陵，盗走了五十几片土器，后被逮捕。 —《毎日新開》1986年12月21日 另外，履中天皇陵在江户时代可能也被盗过了，江户的记录说在陵上发现了巨大的洞。
加个圣德太子墓的状况
平安·1054年，忠禅和尚进了圣德太子墓，在里面作出了奇怪的行为，疑似有破坏太子遗骨的行为。—《盗掘された天皇陵の実態》
（评论区有朋友在问和尚做了什么，这个记录是来自镰仓时代1242年法隆寺的显真和尚的著作《聖徳太子伝私記》，原文描述忠禅和尚奇怪行为只说了“不可思議な作法”，没有具体描述做了什么，忠禅和尚到底做了什么，到现在都是一个谜。）
南北朝时代，北朝的太政大臣洞院公贤（藤原公贤）于1348年2月3日在他的日记《園太暦》里记载了一个传闻，传闻说圣德太子墓里的遗骨被破坏，墓室内的砂金、遗物全被盗走。
另外，美国的波士顿美术馆收藏有声称来自仁德天皇陵的铜镜、环头大刀等文物。宫内厅书陵部曾为此赴美调查了该藏品，宫内厅认为该藏品来自仁德天皇陵的可能性不大。
美国波士顿美术馆收藏的仁德天皇陵环头大刀刀柄（右）
美国波士顿美术馆收藏的仁德天皇陵铜镜
