土壤酸化会影响土壤微生物的活动，因为大多数土壤微生物都对酸敏感。土壤酸化后土壤微生物的数量会减少，微生物的生长和活动受到抑制，并从而会影响到土壤有机质的分解和土壤中碳、氮、磷、硫的循环。
我国对红壤肥力退化的时空变化、退化机制、红壤中养分循环特征等已开展大量研究。但红壤酸化对土壤肥力和养分循环的影响研究有待加强。对酸性土壤的肥力状况及肥力退化的恢复等研究较多，但土壤酸化过程与养分循环的交互作用和耦合机制等方面仍需深入研究。
4 土壤酸化的长期定位观测与模拟预测研究
土壤酸化是一个相对较慢的过程，即使在酸沉降和农业措施影响下短期内也很难观察到土壤 pH 和其他土壤化学性质的明显变化。
美国于1970年开始的一项长期田间试验结果显示，施用铵态氮肥加速土壤酸化，且土壤酸度随氮肥用量增加而增加。根据长期田间试验数据结合土壤 pH缓冲容量可以计算土壤的平均酸化速率，为评估土壤未来酸化趋势提供参考。
酸化模型是研究土壤和地表水酸化的有用工具，特别是基于土壤酸化过程的理论模型在预测土壤和地表水未来酸化趋势及在酸化土壤和地表水的恢复过程研究中发挥了重要作用。模拟预测结果可为土壤酸化控制提供定量依据。
5 酸化土壤的改良与修复
成都新朝阳是国内最早关注土壤健康的公司之一，成都新朝阳公司在2002年就取得了土壤调理剂登记证，长期从事土壤耕地治理修复，成都新朝阳作物科学有限公司完成的“我国典型红壤区农田酸化特征及防治关键技术构建与应用”荣获国家科技进步二等奖。
