在随后的演化中，这些最早的四足脊椎动物，又分别演化成了两栖动物、爬行动物、鸟类以及哺乳动物，而蛇的祖先就是属于爬行动物的一种。
通过现在的化石考证来看，地球上早期的蛇类和蜥蜴相似度极高，只不过后来因为一些原因，导致早期蛇类放弃了自己的四肢，从时间上来看，这个过程至少从一亿年前就开始了。
目前已知的最早的蛇类动物化石，大约来自于1.67亿年前，从时间上来看，是起源于侏罗纪时期，也就是说，蛇类动物的演化，是与恐龙同期的。
一直到大约9000万年前，从这个时候开始，后来发现的所有蛇类动物化石，都已经失去了四肢，已经完全变成了我们熟悉的，光溜溜的模样。
研究认为，大约是从1.13亿年前，早期蛇类选择放弃了四肢，因为这种进化的过程是非常特立独行的，所以，仅仅是为了拥有现在的身体结构，早期蛇类在至少2000万年的时间里，独立进化了26次以上，才终于变成了今天的样子。
当然，这也让蛇类动物成为了地球上的生命奇迹之一，至少在大灭绝之中，它们成功躲过了，而且一直演化至今，成为了地球上进化最成功的动物之一。
一种观点认为，早期蛇类放弃了四肢，是为了更好地活下去。因为在恐龙时代，因为恐龙绝对的霸主地位，事实上，地球上很多生物都是没有竞争优势的，这也让很多小型陆生动物，都被迫走上了一条截然不同的进化之路。
例如中生代海洋中的霸主沧龙，它的祖先就是一种小型的陆生蜥蜴，为了生存下去，才开始朝着海洋生物的方向演化，因为在海洋中没有什么竞争，这也导致它们体型越来越大，由陆地上的失败者，成为了海洋中的一霸。
因此，或许在恐龙的压制下，早期蛇类才会为了生存下去，开始退化到四肢，因为这样一来，它们就可以更好地生活在洞穴之中，而且也会更容易觅食，并且在大灭绝到来的时候，已经完全退化四肢的蛇类，也是在地下洞穴中躲过了一劫。
另一种观点认为，蛇类动物失去了四肢，或许是因为基因突变导致的。这要从2016年的一项研究开始说起。在当时，科学家们将蛇类动物的基因和陆生四足动物进行了对比，结果发现蛇类动物的体内，缺少一个和肢体有关的基因，因此，认为正是大约1亿多年前早期蛇类的基因突变，才导致它们失去了四肢。
