侧滤及背滤是在鱼缸的侧部或背部用玻璃隔出一部分做过滤，其内部分成几小格用于放置滤材和循环泵，一边设有溢流口，当水泵把水从过滤部分抽向鱼缸时，鱼缸溢出的水通过溢流口流入过滤部分的第一格，在隔板的引导下流经各种滤材，水从最后一格通过水泵再次送入鱼缸形成循环。优点：利用鱼缸的内部空间使鱼缸和过滤形成一个整体，不需另外利用其它缸外位置就可以完成较好的过滤流程。一些器材可以在侧滤或者背滤放置，适当放置不影响鱼缸的正面视觉美感。缺点：占用了鱼缸的部分空间，缸内的空间会减少、受鱼缸宽度或长度的限制，放置过滤材料也受限制、水分的蒸发会引起水泵所在间隔的水位较快降低，需要频繁补水。经过1年时间的摸索使用，最后又加上了反气举过滤。
