大棚栽培哈密瓜从育苗到定植都在塑料大中棚保护地内进行。由于我国东南部地区降雨量较大，塑料大棚能有效避免由于阴雨天气造成的地面湿度过大，降低病虫害发生的可能。同时，大棚栽培还能起到保温的作用，能保证春季出苗齐和苗期生长的温度稳定，因此，可以满足春茬和秋茬的两季栽培。春茬栽培在每年的1月至2月上旬进行播种，5月底到6月下旬进行采收；秋茬栽培在每年的7月下旬到8月上旬进行播种，10月中旬到11月上旬进行采收。我国东南部地区具有湿度大、温差小的气候特点，如果将新疆地区的品种直接移植过来，必定难以成活，就算移植成功，产量和品质也难以得到保障。
目前较适宜上海、浙江、江苏等东部地区的栽培品种有：雪里红、黄皮98－18、仙果和东方蜜1号等。而广东、广西、海南等南部地区主栽品种为：仙果、黄皮98－18、新红心脆甜瓜、金龙等。这些品种具有耐弱光、坐果强、抗病虫等特点，亩产量都能达到1500～2000千克。大棚栽培哈密瓜的育苗工作在全年可以分为两次进行，即春茬和秋茬。春茬栽培哈密瓜在2月上旬为最佳播种期。播种前须对种子进行晒种2天，然后浸种处理。浸种时，将种子放入55摄氏度的温水中，并不断搅拌15分钟，让其自然冷却后，再浸种4～6小时。最后用清水冲洗干净，进行催芽。哈密瓜种子的催芽方法有许多，常见的有恒温箱催芽法。这种方法最为安全可靠。催芽前先将恒温箱温度设定在28～30℃，打开电源通电加热并使箱内温度稳定在设定值。然后用湿纱布或湿毛巾将种子均匀平摊在上面，接着用浅盘承载放入恒温箱中进行催芽。一般24～36小时后大部分种子即开始露白。
春茬育苗由于气温较低，影响出苗。应采用电加热温床进行育苗。温床育苗先要平整床底，并在苗床底部铺一层无纺布。建好苗床后就可以开始布线了。一般选用线长120米、功率1000瓦或线长100米、功率800瓦规格的电加温线。布线时苗床两侧布得稍密些，两线间距为6～8厘米；中间稍稀些，两线间距为8～10厘米，这样做的目的是使整个苗床受热均匀。确定好线与线之间的距离后，先在床的两端按要求插入铁丝固定，然后，其间来回布线。布线时要注意线要拉紧不能松动，线与线不能重叠、交叉、结扎，以防止通电后烧线断路。如果线长不够布满床底，可用多根电加热线，注意各根电加热线的引线要引向同侧。固定好电线后，将引线在单相电路中并联后与电源相接。完成了以上的工作，就可以将育苗盘整齐放满苗床了。这里还要提醒大家的是，电加热线必须配合控温仪使用，这样才能在育苗过程中调节、控制温度，得到较为理想的育苗环境。准备好苗床后，就可以开始播种了。
春茬和秋茬育苗都可采用基质育苗的方法，一般选用标准32孔穴盘。播种前，先混合好基质。基质的配制可用碱性轻的陈 糠灰或珍珠岩、泥炭、蛭石按照体积之比1：2：1均匀混合，同时每立方米基质加入商品有机肥2～4千克、15:15:15氮磷钾三元复合肥1千克。初次混好的基质可以直接使用。基质准备好后，就可以往穴盘中加料了，加基质时不宜太满，以便为穴盘留出一定浇水的空间。将装好基质的穴盘整齐码放进苗床中，浇透水，等营养钵中的土完全浸透水之后，就可以进行播种了。播种时，穴盘摆放面应平整、排紧，以利于保温保水。下种之前在营养土上戳一个约1.5~2.0厘米深的孔穴，各孔穴的深度尽量一致，一钵播1粒种子。然后用基质均匀覆盖1厘米左右深度。播种完成后，还要再浇一次水，以保持出苗的适宜湿度。在这里还要告诉大家一个小窍门，浇出苗水的时候，可将45％敌磺钠可湿性粉剂按500～1000倍浓度溶解在水中，这样还能同时预防苗期常见病害如猝倒病、立枯病等。
