北疆军区是历史上新疆军区下辖的三级军区之一
前身为新疆军区所属的伊犁军区，1969年改称北疆军区，1985年撤销。
新疆（乌鲁木齐）军区原为大军区，所属南疆军区、北疆军区、东疆军区为正军级，与省军区同级，下设军分区。1949年12月，以中国人民解放军第一兵团为基础组建新疆军区，为二级军区，隶属第一*军暨西北军区建制。
1950年2月，新疆军区成立喀什、迪化、伊犁军区，分别由第二军、第六军、第五军兼，为三级军区。1955年5月，新疆军区从西北军区划出，升格为大军区，直属中央军委领导。
1979年新疆军区改称乌鲁木齐军区。
1985年6月，乌鲁木齐军区与兰州军区合并，同时成立新疆军区（兵团级），隶属兰州军区领导。
北疆军区原为伊犁军区。
1952年10月，伊犁军区撤销，组建伊犁军分区，仍由第五军兼。
1955年1月，第五军军部整编为伊犁哈萨克自治州军区，同时撤销第五军番号和伊犁军分区；同年11月，伊犁哈萨克自治州军区改称伊犁军区。
1970年4月，伊犁军区改称北疆军区。
1985年6月，全军开始“百万大裁军”。根据中央军委命令，北疆军区被撤销，所属各军分区和*部队转隶属新疆军区直辖。
驻地
1950年组建时驻地伊宁，因该军区领率机关所在地伊宁距离中苏边境仅70公里，过于靠前，为便于作战指挥，1970年4月东迁至沙湾县城，10月又迁至石河子市；1971年10月，北疆军区由石河子再迁至乌苏。
历任领导
一、伊犁军区初期（1950-1966）的领导：
司令员：法铁依伊凡诺维奇列斯肯（俄罗斯族）、伊斯哈克夫马尔果夫（塔塔尔族、1962年外逃）、廖明；
政治委员：顿星云、李铨(56.08) 张世功(一)、廖明(二)
二、1966年5月份文革前伊犁军区的领导：
司令员：廖明
政治委员：张世功
副司令员：江子炎、任书田、肖飞
副政委：李国清、李绍明
参谋长：许欣之
政治部主任：李绍明（兼）
三、改成北疆军区后到撤销（1969.12-1985）的领导：
司令员：龚兴业
政治委员：阳焕生
后期为：
司令员：幸元林、新疆军区副司令员兼
政委：钟良树、王树瑞
副司令员：任书田、赵衍庆、赵増林、阿不都克里木'马合木托夫（1975.9）、李凤友（1975.9）
副政委：李国清、李昭明、刘文锦（兼政治部主任）、张晓中（1975.9）；
参谋长：齐金炳
