南瓜储藏一般有以下几种方式：
1、堆码贮藏。
首先储藏室选用阴凉、没有直射光、空气流通，土质或红砖地面的空间，然后对储藏室进行消毒，再在地面铺上5cm厚稻草或麦秸。南瓜进入储藏室时要严格检查质量，剔除有病虫害、有病疤和过嫩、倒瓤的瓜，在搬运的同时要轻拿轻放，切勿抛滚碰撞。否则过多的震动会引起瓜瓤腐烂。堆放时，保持南瓜挨着地面的方向向下，瓜蒂朝里瓜顶向外码成圆锥形。每堆15～20个，大型瓜不要堆得太多，防止挤压，并有利于通风。
藏初期夜间开窗通风换气，白天关闭遮阳，保持室内空气新鲜、干燥和凉爽适温在10℃左右，相对湿度70％～75％；冬季关闭门窗防寒。
2、分层架式贮藏。
在贮藏室内用竹木或角铁搭成分层的贮藏架，注意每层的高度比南瓜高8～10cm。每层贮藏架上铺5cm厚稻草或麦秸。南瓜摆放状态与堆藏相同，架式分层贮藏效果优于地面贮藏。贮藏中要注意勤检查，发现有病斑的瓜立即剔出以免感染好瓜。
3、地窖低温贮藏。
地窖储藏的方法与堆放类似，需在地上铺垫5cm厚的细沙或麦秸、稻草，入窖时将瓜堆放在铺垫的细沙、麦秆或稻草上，堆瓜二三层。窖温控制在7.2-10℃，可降低呼吸强度，减缓瓜内营养物质的损耗，延缓瓜的衰老过程，贮藏期可达3个月。
