可是随着两人的事业越来越好，两人开始聚少离多，两人之间的感情出了问题，两人在相恋3年后决定分手，但是为了玄彬的事业，宋慧乔决定将分手的消息延后向社会公布。那时宋慧乔考虑到玄彬要服兵役，还有两部新电影要上映，她决定等玄彬服兵役后再公布。
对于宋慧乔的所做所为，玄彬很感激。在他服兵役的第二天，他和宋慧乔分手的消息震惊了韩国演艺圈，玄彬感谢了宋慧乔，感谢她独自面对大众。不过好在两人是和平分手，分手后两人依旧保有友好的联系。
当宋慧乔再次谈恋爱时已经是在2016年，这一年她35岁。她依旧在寻找哪位可以和自己真正厮守终生的人，她在《太阳的后裔》剧组遇到了宋仲基，在《太阳的后裔》火遍全亚洲时，他们也相恋了。对待这份感情，宋慧乔一如既往的认真。那时宋仲基对她也是十分疼爱。
犹记得2016年宋仲基到成都举行粉丝见面会，宋慧乔惊喜现身。在现场的游戏环节，宋仲基赢了宋慧乔，宋仲基必须要用气槌打宋慧乔的头，可是宋仲基舍不得，他说：“这么漂亮的人，怎么打得下去呢”。
在这一年年底的一场颁奖典礼上，宋慧乔大赞宋仲基“幽默、聪明、真诚又温柔”。宋仲基则回赞宋慧乔“真的非常美丽又大方”。在这场颁奖典礼结束后的第10个月，宋仲基和宋慧乔结婚了。在婚礼上宋仲基哽咽地说：“每一次被绊倒，我们都会紧牵彼此的手站起来。”那时他们的爱情感动了无数人，那时他们收获了无数祝福。即使结婚一年，宋仲基还对媒体表示：“我觉得自己还在恋爱中，不会因为结婚而结束恋爱期。”
可是他们之间的感情终究还是结束了，婚姻并不能保证爱情的长久。2019年7月22日，两人正式离婚，宋慧乔给出的理由是：“性格不合”，“未能克服两人之间的不同，最终不得已做出了这样的决定”。
不管两人之间到底经历了什么，但离婚对宋慧乔带来了很大的伤害，她多次被媒体拍到状态不佳。而宋慧乔也曾反思过自己为何感情总是失败，她说自己的性格七分强，三分柔，“我谈恋爱的时候，会变得非常执着，有点倔强……很多时候，都是因为我太执着，所以感情失败了。”
她也明白感情的事情强求不得，勉强不得，她一直记得她妈妈对她说的话，“比起费尽心思做一些成不了的事，还不如顺其自然，就像按照水流的方向行船一样。”也因此对于每段感情她不做过多的解释，作为经历过苦难的人，她很早就明白“只有自己才能守护自己。”而经历多段感情后，她也明白了安全感终究只能自己给予自己。
如今的她依旧期待爱情，但不强求爱情，她说自己的人生没有什么遗憾，“我认真做事了，也认真地爱过，很努力地生活着。”
