有一天，船子和尚与夹山禅师相遇，一番交流，言语投机。船子和尚高兴地说：“钓尽江波，金鳞始遇。”遂传授平生佛理心得，而后覆舟而逝。后来，朱泾法忍寺还建有船子和尚殿，以纪念这位还是唐代著名诗人的高僧。
在漫漫的历史长河中，东林寺几经损毁，又几度修复，然而，到了上世纪五十年代初期，仅有的6名僧人还俗，大殿由当地政府使用，得以完整保存。1987年东林寺大殿被列为上海市文物保护单位。
2007年，重新修建后的金山东林寺，保持了江南典型的清代寺院建筑特色，而且还构思奇特，建造了国内独一无二的寺庙山门，巍峨耀眼的山体大佛，和高达33米，入选世界吉尼斯纪录的东南亚室内千手观音第一菩萨等别具一格的建筑。
寺内左右两侧钟鼓楼中间，是庄严而雅致的金莲池。池内荷花、荷叶全部用金色的铜箔打造，四周围着八条活灵活现的龙鲤鱼，有鲤鱼跳龙口之说。中央最高处的一尊景泰蓝善财童子佛像，堪称是“东林一绝”。
