环境中酸雨的传递途径如上图所示：
①SO2和NOx的排放物被释放到空气中
②污染物被转化为可长距离运输的酸性颗粒
③这些酸粒子然后由于干湿沉降（灰尘，雨水，雪等）而落到地球上
④对土壤，森林，溪流和湖泊造成有害影响
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动物
酸雨的生态效应在水生环境中最为明显，例如溪流，湖泊和沼泽，首当其冲的便是鱼类和其他野生动物。酸性雨水流经土壤时，会从土壤黏土颗粒中置换出铝元素，然后流入溪流和湖泊中。引入生态系统的酸越多，铝的释放量就越大。
大量的铝元素又会有什么危害呢？自然界中，某些类型的动植物能够耐受酸性水和适量的铝。然而其余大部分生物，则对酸环境较为敏感，并且会随着pH的下降而死亡、绝灭。
大多数生物中的年轻物种比成年物种对环境条件更敏感。在pH值为5时，大多数鱼卵已经无法孵化。若pH值继续降低，甚至成年鱼类也会死亡。
另外，一些酸性湖泊没有鱼类。其原因并不完全是鱼类的耐受力问题，即使某种鱼类可以忍受适度的酸性水，但它所吃的动物或植物也可能无法忍受。例如，青蛙的临界pH值约为4，但是它们的食物浮游生物却对pH值更敏感，在pH值低于5.5时可能无法生存。
正如前文所说，生态环境是一个紧密整体，其中任意一环出现了问题，也会对生态环境整体造成损害。
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植物
在受酸雨影响的地区，枯木和萧败是代表性的“景色”。
直接原因仍旧是酸雨从土壤中浸出铝，过量铝对植物和动物有害。更重要的是，酸雨还从树木生长所需的土壤中带走了矿物质和养分，只留下褐色或枯死的叶子和枝干。
然后许多经历酸雨的森林，溪流和湖泊，若无人为干扰的条件下，这些地区的土壤可通过调节中和雨水酸碱度缓和酸雨，是具有一定自承载能力的，不会受到过重影响。
但是人类各项工业活动日益声势滔天，严重超过了生态环境的承载能力，在部分酸、铝的敏感区域，大量聚集在土壤中，破坏自然的平衡法则，导致大量植物死亡。
