不过。在明朝、清朝统治时期，四川省的区划框架，出现了各方面的调整，例如四川省的东川府、乌蒙府、镇雄府、遵义府等地，陆续划入了云南省、贵州省管理。乾隆皇帝在位时期，四川省形成了12个府、9个直隶州、4个直隶厅的区划框架。
分别是：成都府、重庆府、保宁府、顺庆府、叙州府、夔州府、龙安府、宁远府、雅州府、嘉定府、潼川府、绥定府、绵州、茂州、邛州、眉州、泸州、资州、忠州、永宁州、酉阳州、杂谷厅、松潘厅、懋功厅、石砫厅。其中，重庆府下辖了14个县，分别是：巴县、江津县、长寿县、永川县、荣昌县、綦江县、南川县、铜梁县、大足县、璧山县、定远县。
重庆府的地理位置非常重要，属于长江中上游的咽喉要道，连接了西南与两湖之间的航道。1840年之后，西方列强对清朝发动了一系列的战争，例如鸦片战争、清法鸦片战争等等。清朝屡战屡败，不得不割地赔款，签署了各种不平等条约，开放了一系列的通商口岸。重庆作为长江上游口岸与四川的门户城市，蕴含着巨大的市场潜力。
在各国列强的强迫下，1890年，重庆成为了西南地区的通商口岸之一。重庆府成为了西南地区通商口岸以后，地位迅速崛起，经济和城区框架迅速发展。1912年，统治了200多年的清朝灭亡以后，我国进入了军阀混战的复杂局面。尤其是四川各地，大小军阀混战了10多年，对于四川各地经济造成了很大的破坏。再加上四川部分地区土匪猖獗，百姓的日子很苦。
1937年，日本发动了卢沟桥事变，我国开始了全面抗战。随着战争局势的不断变化，北平、南京、武汉、广州等大城市先后失陷。当时的政权，最终迁都重庆，重庆成为了陪都、战时首都。鉴于重庆市的重要地位，1939年，重庆市被提升为特别市。特别市类似于直辖市，并不完全一样。从1939年开始，重庆市脱离了四川省，成为全国6大特别市之一。
一转眼到了建国初期，随着大规模战争的基本结束，我国进入了经济建设、恢复生产的阶段。出于管理大城市的实际需要，除了北京、上海、天津等传统直辖市以外，重庆市、沈阳市、西安市、武汉市、广州市等区域性大城市，也被确立为直辖市。建国初期，我国总计确立了10多个直辖市。
这一阶段，重庆市作为直辖市，仅仅管理了主城区，下辖了7个区，分别是：市中区、江北区、沙坪坝区、九龙坡区、南岸区、北碚区、南桐矿区。1954年，在全国区划全面调整的大环境下，重庆市、广州市、武汉市、西安市等直辖市被陆续降级。重庆市被降级以后，重新划入了四川省管理。
重庆市的管理范围太小，仅仅管理主城区。很多项目和工程的推进，都面临空间不足的问题。同时，川东各地各个县，经济薄弱，需要大城市的扶持和带动。50年代末期，在四川省新一轮的区划变迁中，出于扩大重庆市管理范围的需要，同时减轻川东各个专区的压力，四川省江津专区的巴县、綦江县、涪陵专区的长寿县，陆续划入了重庆市管理。
