一、物理性质不同
一水柠檬酸密度1.54g/cm3，熔点135-152℃，闪点173.9℃，水溶性1630g/L，水分7.5-9.0%；
无水柠檬酸密度1.542g/cm3，熔点153-159℃，达到175°C以上会放出水及二氧化碳，闪点155.2 ℃，水分≤0.5%。
二、化学性质不同
一水柠檬酸遇明火、高热或与氧化剂接触，有引起燃烧爆炸的危险，遇高温后不稳定，在干燥空气中略有风化。溶于水、乙醇、乙醚，不溶于苯，微溶于氯仿。
无水柠檬酸在干燥空气中微有风化性，在潮湿空气中有吸湿性，加热可以分解成多种产物，可与酸、碱、甘油等发生反应。溶于乙醇时与乙醇反应，生成柠檬酸乙酯。
三、分子量不同
一水柠檬酸的分子量为210.14；
无水柠檬酸的分子量为192.13。
四、应用领域不同
一水柠檬酸主要用于食品、饮料行业，作为酸味剂、调味剂及防腐剂、保鲜剂；在化工、化妆品、洗涤行业中用作抗氧化剂、增塑剂、洗涤剂。
无水柠檬酸也应用于食品、饮料行业，但使用最多的部门是化学制造，其次是造纸、炼铝、炼钨、人造丝、人造棉和肥皂制造业。另外，在生产染料、塑料及有机中间体，旧橡胶的再生，制金属钠、水的电解以及无机盐生产中，制取硼砂、铬盐、锰酸盐、磷酸盐等，也要使用大量的无水柠檬酸。同时无水柠檬酸是生产聚碳酸酯、超级吸收质聚合物、沸石、环氧树脂、磷酸钠、亚硫酸钠和大量钠盐的重要原材料之一。
