欢乐的时光总是短暂，故事的发展总会经历波折。
藤本发现女儿不见了，立马寻找，发现波妞在人类家里。
他认为人类世界充满肮脏丑陋，海洋遭到的破坏来自于人类，因此他强行把波妞带回海底。
可没来得及好好道别的波妞无比想念宗介。通过妹妹们的帮助，波妞突破父亲的阻碍，大胆而坚定地要去找到宗介。
没想到的是，波妞的变化引发了失控的生命之水。
而她决意寻找宗介的行动，也无意间引发了一场席卷小镇的海啸。
为了避开海啸，宗介和理莎驾车往回赶，结果看到了在巨浪中奔驰的波妞。
两个孩子终于又再次见面了。
宗介承诺要永远保护波妞，似乎未来在朝着幸福的方向前进。
重逢的喜悦掩盖了一切，海啸也逐渐平静。
但是会魔法的波妞要为自己的选择付出代价。
理莎在安顿好他俩后，冒险前往养老院帮忙，可海啸过去，小镇损毁得面目全非。宗介担心理莎，便带着波妞去老人院找她。
