一、用途不同：
1、耐候胶适用于各种幕墙耐候密封，特别推荐用于玻璃幕墙、铝塑板幕墙、石材干挂的耐候密封。对金属、玻璃、铝材、瓷砖、有机玻璃、镀膜玻璃间的接缝密封。也可以对混凝土、水泥、砖石、岩石、大理石、钢材、木材、阳极处理铝材及涂漆铝材表面的接缝密封。大多数情况下都无需使用底漆。
2、中性结构胶主要用于玻璃幕墙的金属和玻璃间结构或非结构性粘合装配。它能将玻璃直接和金属构件表面连接构成单一装配组件，满足全隐或半隐框的幕墙设计要求。也可对中空玻璃的结构性粘接密封。
二、作用地方不同：
1、耐候胶也称密封胶，主要用于材料之间的密封填缝，接缝的防水密封。
2、而中性结构胶也称幕墙结构胶，主要是用于各种幕墙的结构性和非结构性装配的粘接，两者作用的地方不同。
三、粘结能力不同：
1、耐候胶也可以说是通用胶，主要是具有抗紫外线、酸雨、雪等极端的天气。 耐候胶的位移能力（可作弹性解释）要高于结构胶。
2、硅酮结构胶除了具有耐候密封胶的特性外，还具有比耐候候密封胶更强的粘结性能，主要表现在抗撕裂强度、断裂延伸率、拉伸强度比较强，拉伸强度主要用在予应力的地方。结构胶的模量、硬度、强度及价格都要高于同档次的耐候胶。
