不难发现，扬州大学的问题是，只有农科的几个一级学科拿得出手，但是扬大又对外宣传自己是综合性大学，所以在学科发展和未来布局中，绝对不可以顾此失彼只发展农科。
扬州大学的前身通州师范学校和通海农学堂在1952年的院系调整中，农科和代办的文史专修科西迁扬州，组建苏北农学院和苏北师范专科学校。不过好在其他4所院校也在同时期相继在扬建立或迁来扬州办学，扬州师范学院、江苏农学院、扬州工学院、扬州医学院、江苏水利工程专科学校、江苏商业专科学校等6所高校合并。
这些合并的院校中，只有扬州师范学院、扬州工学院和江苏农学院尚具实力，文院是扬州大学申请到的第一个博士点。在1981年成为博士授权单位的高校之一，全仰赖任老之功，但在老一辈教授们2005年前后过世，师范学院实力开始逐渐下滑。加上当时的江苏省高教一直围绕着南京大学、东南大学、苏州大学、南航、南理等顶尖院校，实力稍逊的扬州大学再难以与它们抗衡，现在在整个江苏的名气也逐渐失去。
在第二轮双一流大学名单中，在第一轮140所基础上新增了山西大学、南京医科大学、湘潭大学、华南农业大学、广州医科大学、南方科技大学、上海科技大学等7所高校，这其中的华南农业大学“作物学”学科成功进入此轮。
现状是，扬州大学的兽医、畜牧、作物是最好的三个一级学科，排在后面的植物也算勉强凑合。华南农业大学的作物学也只得到了一个B，但学校处在华南地区，能入选一定是战略层面；同省的南京农业大学作物学是个A ，没有不入选的道理，上下左右受到限制的扬州大学很难得到机会。
畜牧、兽医同样受限于南京农业大学，不过A-的扬州大学还是要比B 高出一个档次，完全有理由和底气去争下一轮。
坏消息是，在尝到了双一流甜头的华南农业大学，准备举全校之力增设兽医，扬大很可能还是争不过原农业部嫡系的华南农大，毕竟人家是正儿八经的叫农业大学。而扬州大学正在通往综合性大学发展的道路上越走越远，学科发展越来越均衡，经费不少，却不偏袒。
扬州大学要想取得突破，可能还有很长的路要走。
