2月8日,记者从八师石河子市疾控中心了解到,该中心分别于1月22日、2月3日完成了两轮新型冠状病毒基因组测序工作,全面了解春节期间石河子新冠病毒是否存在变异情况。经过两轮新冠病毒基因组测序,得到两轮样本测序,结果均为奥密克戎变异株BA.5.2和BF.7,与春节前检测数据基本一致,没有发现新的变异株输入。
师市疾控中心检验科科长唐牧说:“我们开展基因测序的目的,主要就是为了尽快发现变异株,然后尽快进行预防和处置。从大年二十九开始,我们放弃了休息时间,大年三十、大年初一完成了基因测序的第一次检测工作。第一次基因测序检测了石河子市人民医院和石河子大学第一附属医院送来的7份样本,未发现新型变异株。”
当天,在师市疾控中心的PCR实验室里,测序小组成员正在认真检测由石河子市人民医院和石河子大学第一附属医院送来的新冠病毒样本。
记者了解到,新冠病毒基因组测序实验过程十分繁琐,检测样本要经过试剂准备区、标本制备区、扩增及产物分析区处理才能初步得到一组实验数据。其中,标本制备是最为繁琐的一个环节。
与以往的核酸检测不同的是,基因组测序实验数据能更加精准地掌握新型冠状病毒的变异情况和测序确定的病毒分支类型,从而为师市新发突发传染病的鉴定溯源、应急处置提供技术支持。开展这样一组基因组测序实验成本高达2万元,远超核酸检测成本。
“我们的测序工作首先是进行测序样本的初筛,选择符合测序要求的样本,再进行测序文库制备。测序文库制备是一种基于高通量测序技术的大规模平行测序方法,包括RNA反转录、多重PCR扩增、多重PCR产物纯化等工作。测序文库构建出库产物通过滚环扩增的方法制备DNA纳米球,采用Cpas联合探针锚定聚合技术进行测序,测序完成后通过软件进行数据分析,最终取得新冠病毒基因组分析报告。”疾控中心检验科负责基因测序人员周钻说。
据介绍,近期,师市疾控中心将继续扎实开展人员培训工作,储备技术力量,为迅速开展新冠病毒测序分析及溯源工作夯实基础。