琼脂糖凝胶电泳（Agarose Gel Electrophoresis）用琼脂或琼脂糖作支持介质的一种电泳，用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。对于分子量较大的样品，如大分子核酸、病毒等，一般可采用孔径较大的琼脂糖凝胶进行电泳分离。琼脂糖凝胶电泳的分析原理与其他支持物电泳最主要区别是：它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。
图1 琼脂糖凝胶电泳示意图
琼脂糖凝胶电泳原理
琼脂糖凝胶电泳，是以琼脂糖为介质，对不同大小的 DNA 或 RNA 实现分离的一种电泳方法。琼脂糖是一种多糖，具有亲水性，但是不带电荷。使得 DNA 在碱性条件下使其带负电荷（pH8.0 的缓冲液），在电流作用下，以琼脂糖凝胶为介质，由负极向正极移动，根据不同的 DNA 分子片段的大小和形状不同，在电场中泳动的速率也不相同，同时在样品中加入染料（如 EB 或花青素类染料）能够和 DNA 分子间形成络合物，经过紫外照射，可以看到 DNA 的位置（比对 marker 可知分子量大小），从而达到分离、鉴定的目的。
图 2 琼脂糖凝胶电泳原理
琼脂糖凝胶电泳步骤
琼脂糖凝胶电泳的实验步骤，包括样品准备、凝胶制备、电泳运行、染色观察等关键过程，通过这一方法，研究人员能够迅速获得关于核酸片段大小、纯度以及特定序列存在与否的信息。
电泳装置 电泳装置主要包括两个部分：电源和水平电泳槽。电源提供直流电，在电泳槽中产生电场，驱动带电分子的迁移。
图3 电泳装置
琼脂糖凝胶电泳浓度
琼脂糖凝胶浓度与线形DNA的最佳分辨范围：
