结构不同: 樱花树高15-25米，树冠扁圆形。树皮暗粟褐色，光滑而具横纹状光泽，老时变为灰褐色而粗糙。叶卵形至椭圆形，先端尾尖，边缘具芒齿，幼叶淡绿褐色，后叶表绿色，叶背淡绿色。单叶互生，具腺状锯齿，花单生枝顶或3-6簇生呈伞形或伞房状花序，与叶同时生出或先叶后花，萼筒钟状或筒状，栽培品种多为重瓣;果红色或黑色，5-6月成熟。
樱桃树高6-8m。嫩枝无毛或被柔毛。叶片圆形至椭圆形，基部圆形或广楔形。花3-6朵，成伞形花序或有的总状花序，花径3cm，具短柔毛，果实近圆球形或心脏形，直径1-2cm;果皮红、粉红、紫红或乳黄色，皮薄;果肉柔弱多汁，不耐贮运。
另有资料说: 1、树干上有眼睛模样斑纹的是樱桃树，没有的是樱花树。即:樱桃树干上有“眼睛”，樱花树干上没有“眼睛”。 2、樱花花蕊比较集中，相对花瓣来说比较小。樱桃花蕊比较分散，几乎占满了整个花瓣。 3、樱花花瓣末端有缺刻，樱桃花没有。 樱花树与樱桃树，种属不同，品质不同，命运也不同。
樱桃苗的植株属于李属类植物，它的果实可以食用，植株一般都为丛生；樱花苗属于蔷薇科，它是一种落叶常用绿抄化乔木，仅具有观赏价值。
种植区域不同：樱桃苗适合在中国南部地区种植，喜爱温暖的环境；樱花苗多种植于中国或日本，在中国多分布在长江流域地区。
花期不同：樱桃苗的花期在3月份；樱花苗4月开花。
