绿色眼睛是最罕见的一种，常见于中亚血统人群，尤其是阿富汗的普什图族、巴基斯坦、哈撒克、乌兹别克、吉尔吉斯、吉普塞和伊朗等眼睛是绿色的。
眼珠是绿色，是因为眼睛中的虹膜色素含量少，所以眼睛颜色为较淡的绿色。眼睛的颜色是指被虹膜覆盖的眼球中间部分的颜色。虹膜包含许多色素细胞，色素细胞中黑色素的含量决定了虹膜的阴影。
眼睛有绿色的人，是因为他们的虹膜中黑色素比蓝眼睛的人还要少，但同时又有较多呈黄色的脂色素。光散射产生的蓝色配上脂色素的黄色，就成了那种富有邪魅感的绿色。
根据科学统计，在全世界拥有绿色眼睛的人只有2%左右，而且女性人数偏多，一般情况下，在欧洲一些地方，尤其是北欧为主的人群，绿色眼睛的比例是最高的，其实绿色眼睛的色调是由于黑色素的含量低，以及和脂色素过多造成的，而这种脂色素可以让眼球偏黄，所以就会产生出一种罕见的绿色晶状体。
