然而，世界上最痛苦的事莫过于同最爱的人分离。1936年鲁迅去世，许广平开始了她的后半生。她决心将鲁迅的事业继承下去，开始了漫长的鲁迅作品整理工作。1937年上海沦陷，日军开始了惨无人道的烧*抢掠。上海文化领域的损失格外惨重，复旦大学的校舍被日本飞机炸毁，昔日学生朗朗成诵的教学楼成了一片废墟；上海的四大出版机构也都被日军轰炸，无数的图书文稿毁于一旦，商务印书馆被烧毁的那天，空中飘着无数纸张，像是一场凄厉地大雪，显示着日军在中华大地上的暴行；上海各大学被迫举校南迁，师生们无法带走全部的教学器材和资料，只能狠心的将宝贵的资料遗留在原地；复旦大学甚至成为了日军驻军的军营。
在这样的环境下，大家都劝带着一个孩子的许广平离开上海，但却被她坚定地拒绝了。因为她认为鲁迅的遗产都留在上海，为了保护这些珍贵的书籍和文稿，她必须也一起留在上海。她说：“......凡是鲁迅先生留下来的，都好好地保存起来，这不是私产，这是全国人民，凡是要了解这一时代文化，这一位作家生活的人......”她认为这些财产对未来人们了解鲁迅这一位作家来说，是相当宝贵的财富，所以她愿意守在这里。
可是凶恶的日军怎么会放过她，在1941年12月15日，寒冷的冬日里，太阳还没升起来，日军宪兵队就闯入了许广平位于霞飞路的家里，不顾许广平的哀求，毫不客气地收走了一大批的书籍和报刊，又要把许广平也一起带走。许广平在临走前，将12岁的仍在病中的周海婴托付给了朋友，怀着满心的忐忑与不舍，被带到了当时令人闻风丧胆的“日本宪兵队总部”。
许广平被关进了一间窄小的囚室中，这小小的空间里却挤满了人。空气中弥漫着血腥味和臭味，人人挤在一起，就犹如被装进袋子里的老鼠，凄惨地等待着自己的命运。里面有些人已经接受了多次拷打，有人满身血污脓肿，已经十分虚弱；还有人被折磨地患上了精神病，在人群中钻来钻去；有人生了病，不停地腹泻。每个人的心里都忐忑不安，充满着恐惧。但就在这样的情况下，哪怕有人发出一声痛呼，都会被日本兵严厉的训斥，他们手持木棍，凶恶地击打囚室内的人们，人人苦不堪言。随时有人被带走，镣铐叮叮当当地响着，远远地传来人的哀嚎声和痛苦声，这实在是一个非人的地方。
许广平也受尽了折磨。日本兵首先对她采取怀柔政策，先是哄她说只要她交出抗日分子的名单和住址，就会尽快让她回家看自己的儿子。日本人利用一个母亲爱孩子的心里，想要让许广平屈服。但无畏的许广平怎么会在大义面前为了家庭的小爱供出自己的战友，她坚决地拒绝了日本人的要求。接下来，日本人又欺骗她说，她的朋友们已经供出了名单，她现在说也无妨，因为他们早就知道了。
并说有人供出了许广平的住址，所以她才会被抓。对于那种出卖自己的人，她没必要为他们隐瞒，应该快快地说出来。毫无疑问，这样的手段是骗不到许广平的。接着，日本人又诱惑她，说只要供出文化人士中的抗日分子，她就会受到礼遇，还会获得各种各样的好处。但许广平仍不屈服。眼看什么招数都没用，日本人露出了凶恶的真面目，威胁许广平说，如果她不乖乖听话，她就和囚室里遍体鳞伤的人的下场一样。但身体的痛苦怎能吓住英勇的斗士，许广平是不屈服的。
日本人看无论怎么游说都无效，便开始对许广平进行了一系列的严刑拷打。日本人摘下了他们“平和友善”的面具，露出了凶恶狠毒的真面目。如果许广平的回答不是他们想要的，日本人就会对她大打出手。他们狠狠地扇她巴掌，殴打许广平的面部，让许广平感觉昏天黑地，头脸猛烈地疼痛，她不禁多次昏迷又被打醒。
之后，日本军官又用军靴狠踹许广平的大腿，让许广平被打得遍体鳞伤，气息奄奄。许广平在疼痛中一直鼓励自己，她在自己的回忆录中写记载了她当时的心情：没有受过审讯拷打的人可能很难理解为什么有人会叛变，因为那痛苦实在难以想象。但是，这时她心中更多的是那些忍受侵略者的拷打和非人的虐待，死不低头，绝不背叛革命事业的英雄豪杰。为什么我们不像这些更伟大的人学习呢？许广平深深地记着这些，一直用英雄们的事迹勉励自己，绝不低头，绝对不能低头。就这样，她坚决不回答日军的问题，经受着一次又一次的残忍地折磨，但她决不投降。
日军抓捕许广平的原因很简单，他们就是想要知道上海潜伏着的文化界人士中的抗日分子都是谁、都住在哪里、都有哪些组织和集体。一旦许广平供出他们的姓名，日本人就会立刻出发，将这些人都逮捕归案，如果这种事情真的发生，那无论是对中国文化界，还是对抗日活动，都会造成巨大的损失。许广平深知这一点，所以她绝对不会退缩投降。而且早已预料到日本人会对自己出手的她，早早地就将抗日相关的资料和朋友们的书信转移到了其他地方，日本军是很难找到的。在拷问中，她始终坚持自己只是一个家庭妇女，早已不了解任何政治相关的东西，不过是孤儿寡母的生活在这里，过去的朋友也早已不来往了。
当然，日本人是不会被这样简单的解释说服的，他们又继续对许广平进行了更为惨无人道的折磨，企图从她口中套出信息。
一次，他们突然让许广平脱下全身的衣服，这对一个女人来说，可谓一个极其恐怖的信号。不过许广平的精神是强韧的，她听着日本军的指令，脱下了衣服。但随即，日本人又让她穿上衣服，就这样来回几次，脱了之后又穿上，穿了之后又脱下。日本人是想用这样卑劣猥琐的伎俩，使一个女人屈服。
但许广平仍不愿意说任何话。日本人凶暴的鞭子抽在她的身上，不过一会儿的功夫，她的身上就已经伤痕累累，但她仍不屈服，只是心中对日本人的恨意又深重了几分。日本人又威胁她，说要让她浑身赤裸的游街示众，他们想彻底摧毁一个女人的尊严。可在许广平的心中，这一切又算得了什么，一切都比不过她心中坚定地革命理想。许广平根本不屑于日本人的这些诡计，日本人无法之下，只得罢手。
但接下来，更为惨无人道的拷问向许广平袭来。日本人对许广平施加了电刑。这一段经历许广平曾在她的回忆录《遭难前后》中详细地记录了。电流滋滋的声响在耳边响起，全身通着电，从大脑到血管，每一个脏器，每一个细胞都被痛苦地煎熬着，这份痛苦无比的难熬，甚至没法用简单的文字形容出来。日本人更是一次又一次的加强电流，让许广平的折磨不断加深。许广平心中对日本人的恨意已经难以言喻，她一次次的昏迷又醒来，却绝不愿说出一个字，她宁可死，也不愿对日本侵略者投降。
在长久的拷打中，许广平的身体每况愈下。她的整张脸都因为殴打而肿起来，大腿青青紫紫，双腿几乎不能行走，这也给她留下了永远的后遗症，在之后的很多年里，许广平的腿都存在病痛。她的双眼早已肿大，全身被鞭子抽打的血迹斑斑，虽然她浑身疼痛不堪，但即使这样，她的意志也一直没有屈服。
许广平入狱之际，我党人士袁殊展开了营救工作，他先是根据《关于苏州地区清乡工作之日华协定》中的条款，向上海特工总部头子李士群提出释放许广平的要求，他的依据是鲁迅曾在日本留学，现在又已经去世。日本人折磨人家的遗孀，无疑影响不好。就这样，许广平被从日本宪兵部转移到了七十六号，鲁迅生前的好友内山完造接到袁殊的消息后，前往七十六号将许广平保释了出来。就这样，许广平76天的牢狱折磨，终于结束了。但牢狱生涯给她带来的种种后遗症，比如不再灵活的双腿，却从此一生伴随着她。
许广平被保释的那天正是当年的元宵节，她又再一次见到了她的儿子周海婴，海婴对母亲的回归感到无比的开心，接连几日脸上都挂着笑容。许广平母子终于又团聚了。但她仍不忘自己的使命，也仍然担心着朋友们的安危，她不愿自己的经历在别人身上重演。于是她立刻请鲁迅的弟弟周建人通知各位朋友们，请他们不要来看她，也一定要注意自身的安全，小心日本的特务的监视。就像这样，无论什么时候，许广平都是大无畏的心系着革命事业的。她伟大的精神，不禁让我们为之折服和感动。
许广平一生也没有忘记这一段“难忘”的牢狱经历，在抗战胜利之后，她书写了记录她牢狱生活的回忆录《遭难前后》，记录了这一段充满着血泪的回忆。她仍然以犀利的文风发表了难以计数的作品，面对内战，她也曾犀利的质疑国民党反动派们的行为，质问为何在抗日战争中畏首畏尾，不敢应战，面对同胞却丝毫不肯退让，自相残*。她仍然继续整理鲁迅留下的书信集、杂文集，出版了《鲁迅书简》。建国后，她积极地参与政治活动，先是当选为全国政协委员，随后又被中央人民政府任命为政务院副秘书长。许广平把鲁迅的作品著作权无偿交给了国家，并且将鲁迅的所有遗物也一并献给了国家。因为她良好的保存，这才让鲁迅的作品没有遗失在炮火中，而是一直流传至今。她把自己的一生献给了国家、献给了民族、献给了人民。
