但是，芬兰的国家发展史却并不顺利，瑞典摄政比列尔·雅尔时期，就于1249年通过第二次瑞典十字军攻占了芬兰，经过一系列纵横交错的战争与谈判，在1362年，芬兰的代表获邀参加了瑞典国王的选举，象征着芬兰正式融入瑞典王国。好景不长，仅仅过了不到20年的时间，瑞典就爆发内战，内战的胜利者玛格丽特一世成立了卡尔马联盟，不过这并没有带来和平，芬兰的实际控制权一直在瑞典和俄罗斯之间交替，包括还被德国占领过一段时间，直至1991年苏联解体后，芬兰终于可以自己决定命运并在4年后加入欧盟，很难想象现在这个富庶而和平的国家以前常年饱受战火的摧残，也是正是因为战争的残酷，使得芬兰人对和平倍加珍惜。
在宗教方面，也是混乱不堪，甚至前文提到的瑞典十字军第二次进攻，就是因为当地人不肯改信基督教而爆发的宗教战争。到了1529年，德国实行了宗教改革运动，此时马丁·路德在德国创立了基督教新教，标志着基督新教的诞生，因为是马丁·路德创立的，所以又叫做基督教路德宗，并于16世纪传入了北欧诸国并被芬兰广泛接受，而芬兰又被俄罗斯占领过，所以有一些地方的人也偏向俄罗斯和东正教。
虽然十分复杂，不过博物馆内的展品可以展现整个芬兰宗教发展史，目前大约有77.7%的芬兰居民信奉基督教路德宗，1.2%信奉东正教，此外还有罗马天主教、穆斯林、犹太教等等其他宗教。
