和代森锰锌、三乙磷酸铝等混配，可预防低等真菌如霜霉病疫病的危害。
和异菌尿、腐霉利混配，可防治灰霉病及菌核病。
和克菌丹或咪鲜胺混配可用于红薯保鲜。
和硫磺混用对白粉病效果显著。
和井冈霉素混配能提高水稻纹枯病防治效果。
需要注意的是，多菌灵易产生抗性，一个生长周期，不建议多次使用。
由于多菌灵过度使用会对大脑有损伤，造成脑麻痹，也易诱发肝部肿瘤，如今在欧美多个国家禁用或限用，虽然我国还未把多菌灵禁用提上日程，但加大了残留检测力度，一旦含量超标，种植户辛苦种植出来的农产品，就可能面临被拒收的风险，所以，合理使用、不滥用才是科学的施药方式。
三、种子处理比较常见的种子处理剂有16%克百威 多菌灵悬浮种衣剂，属于高毒农药，仅限于小麦包衣，现如今已逐渐退出市场。
16%吡虫啉 萎锈灵 多菌灵悬浮种衣剂，可用于小麦、棉花、中药材等种子包衣或蘸根处理，可防治生长期蚜虫、地下害虫及预防根部病害及苗期病害。
多菌灵，曾经的王牌*菌剂，70年代由美国杜邦公司推出，具有内吸保护功能，*菌谱非常广，但有个最大的缺点，就是易产生抗性，80年代成为我国使用量最大的*菌剂品种，不过，从2007年开始，美国怀疑多菌灵产生健康风险，撤销该药在食用农产品上的登记，2016年我国农业部门启动多菌灵安全警告，减少多菌灵在我国使用。
目前我国是多菌灵生产大国，全球需求量约4万吨左右，出口占四分之三的份额。
其实，不单是多菌灵，绝大多数农药都属于双刃剑，用好了，会对农业安全生产作出巨大贡献，用不好就会对人体、环境、生物及微生物等产生副作用。
不过，随着新型低毒低残留的农药不断问世，多菌灵作为曾经的王牌*菌剂，如今已经风光不再，但在某些领域，如和其它*菌剂混配防治部分土传病害或混配防治部分叶部病害，依然属于极具性价比的*菌剂，这也是人们热衷多菌灵的主要原因之一。
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