消毒的目的是阻止外部病源微生物侵害鸡体，排除和*灭鸡饲养过程中蓄积于舍内外的有害微生物，维持舍内外的清洁度，防止传染性疾病在鸡群间传播。
一、影响消毒的因素
许多因素可降低消毒效果，如舍内外残留有机物等污染物;使用硬水，如含钙、镁、铁较高的水配制消毒剂;温度过高对某些消毒剂，如碘制剂、氯化物制剂有影响;消毒时间过短，使用方法不当，稀释浓度太低，喷洒不均匀等。
二、几种常用消毒药品
1、氢氧化钠(烧碱、苛性钠)
常用1-2%溶液来消灭病毒和细菌。对金属、油漆物品均有腐蚀性作用。
2、过氧乙酸
市售20%的溶液，其本身有强大氧化性，*菌作用快而强，对细菌、病毒、霉菌和芽孢均有效。常用含本品的0.3~0.5%水溶液作各种消毒，效果好，费用低。
3、高锰酸钾
常用0.1%溶液，能*死细菌。
4、甲醛溶液(福尔马林)
市售含量为40%，有强大的*菌作用和刺激作用。与高锰酸钾配合对舍内进行熏蒸，密闭24小时，达到空间消毒。
5、新洁尔灭
常用5%溶液，用于皮肤、粘膜、用具的清洁消毒。
6、次氯酸钠
常用2%,3%溶液对鸡体喷雾消毒。可用于鸡体喷雾消毒的还有过氧乙酸、新洁尔灭等。
三、消毒操作程序
彻底清除鸡舍、地面、墙壁、附属装置上的灰尘、污物、粪便、垫料、饲料、羽毛。排风口、明沟等地均要彻底清洗干净。应做到先清扫，后冲洗，再干燥(数天)，最后消毒。
一般消毒3~4次，通常用两种以上的消毒剂交替使用。第二次消毒要等第一次消毒剂干燥后再进行。从清扫到消毒完毕，整个过程不得少于14天。
