有机肥的第一种使用方法，追肥的时候使用。植物在生长期的时候，需要进行追肥，最好就是复合肥和有机肥一起使用，一般会按照1比1的比例进行施肥。作物不同，施肥的距离不一样，复合肥掺加了有机肥之后，不容易烧根，而且还能提高复合肥的吸收转化率。
在秋天末期的时候，大多数的作物也会施肥，一般会按照1比2的比例进行施肥。冬天即将进入休眠期，两倍的有机肥使用量，可以提高土壤有机质的含量，并且还能提高作物抗寒的能力，对于根系有比较大的保护作用。
在种植作物的时候，有机肥还能拌土使用。尤其是一些盆栽的植物，对于土壤的要求比较高，可以在土壤里添加上适量的有机肥，有助于根系的生长，并且能够最大限度的保护土壤，减缓土壤板结的时间。
有机肥的效果比较的缓慢长效，没有复合肥那么明显，但是有机肥最大的作用就是提高植物的抗逆性，让作物生长得更健康。但是假的有机肥也比较多，需要谨慎。另外需要注意，复合肥和有机肥掺杂之后使用，一定要开沟覆土。很多的有机肥含有大量的活菌，如果被太阳暴晒，活菌的生存率会明显下降。
