科属区别：棒花鱼属于鲤形目鲤科，虾虎鱼则属于鲈形目虾虎鱼科。鱼鳍区别：棒花鱼的背鳍发达，虾虎鱼则具有特殊的脊鳍。生活环境区别：棒花鱼生活在淡水中，在中国、日本、朝鲜分布广泛，虾虎鱼则主要生活在热带和亚热带的海域中。寿命区别：相比之下，虾虎鱼的寿命要更短一些。
棒花鱼和虾虎鱼都是鱼类之中比较有名的。有些人认为二者是相同的，但其实这是一种错误的观点，棒花鱼和虾虎鱼并不是一样的。实际上，二者的差别是非常大的，它们的类别差异就比较大，所属的目和科都是不同的，说明二者也并没有很近的亲缘关系。另外，从外观特征以及生活习性、寿命等方面来看，棒花鱼和虾虎鱼也有不小的差异，因此不能将二者混同。
二、棒花鱼与虾虎鱼有什么区别1、科属区别：上文已经介绍过，棒花鱼和虾虎鱼的类别差异比较大，前者是鲤形目鲤科的，后者则是鲈形目虾虎鱼科的，可见差异十分显著，亲缘关系也并不近。
2、鱼鳍区别：从外观来看，棒花鱼和虾虎鱼比较明显的一个差异就体现在它们的鱼鳍上。棒花鱼的一个重要特征就是它们的背鳍十分发达，是弧形的；而虾虎鱼的一个重要特征是它们有脊鳍。
3、生活环境区别：棒花鱼和虾虎鱼的生活环境也不同。棒花鱼属于淡水鱼，喜欢生活在江河湖泊的底部，在我国淡水之中的分布范围十分广泛，在南方以及北方的水系之中都有，另外在日本和中国也有分布。而虾虎鱼则是生活在海洋中的，尤其在热带和亚热带海域中的分布广泛，只有少部分可以适应淡水中的环境。
4、寿命区别：棒花鱼和虾虎鱼的寿命也有差异。虾虎鱼寿命比较短，有的只能活两个月左右，而棒花鱼的寿命相对来说长一些。
5、别称区别：棒花鱼和虾虎鱼具有不同的别称。前者别称有“爬虎鱼”、“沙锤”等，后者别称有“鰕虎鱼”等。
