mirna靶基因预测,如何查mirna的靶基因是否保守

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miRNA才是科研的新手之友。

MicroRNA研究是一直国内外研究的热点领域，每年都有大量的microRNA相关文章发表或相关基金申请，而microRNA功能研究最重要的是其靶基因的确认，荷叶今天给大家介绍一些常见的microRNA靶基因预测工具。

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TargetScan

网址：新版 http://www.targetscan.org/vert_72/

老版 http://www.targetscan.org/mamm_31/

TargetScan用起来很简单方便，输入基因名能查出某个基因3’UTR可能的作用多个microRNA。最新版的TargetScan还人性化的列出目前发现的多种3’UTR。输入microRNA名则能查出某个microRNA可能作用的多种靶基因。

图1 TargetScan网站中查找目标基因的候选miRNA

图2 TargetScan网站中查找目标miRNA的候选靶基因

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miRcode

网址： http://www.mircode.org/index.php

miRcode与TargetScan相比，主要增加了ncRNA和非3’UTR区的检索。