雷公、炎帝和水君
继第一世代的传说的鸟宝可梦之后，第二世代出现了和传说的鸟宝可梦极为相似的传说的三圣兽：雷公、炎帝、水君。它们设计的原型派生于虎、狮、狼，涵盖了陆上食肉动物。传说很久以前，祭拜洛奇亚的钟之塔由于电光而着起了大火，在这场火灾中，有三只普通的宝可梦被火烧死了。此时，凤王现身，让它们重生，并赋予它们强大的力量。当主角在烧焦塔下将它们解放后，它们将游走于城都各地，有的还到了临近城都地区的关都地区去。
游戏中的传说的三圣兽比起第一世代的传说的鸟宝可梦来说，捕捉难度大大地提升了。它们不再待在固定的地点，而是会游走于整个地区。在对战时，它们经常会使用吼叫来逃跑。在后来的《水晶版》中，传说的三圣兽中最受欢迎的水君被选作游戏封面，并且更增加了与水君有关的剧情，这些剧情在后来的《心金／魂银》中得到延续。在《火红／叶绿》中也可以遇到它们。
动画中的它们曾多次登场，但多半是单独出场。电影和OVA中也有着它们的身影。在幻影的霸者 索罗亚克中，更是让颜色不同的3只传说的三圣兽同时登场。
在特别篇漫画中，传说的三圣兽们环游各间道馆挑战道馆馆主，来选择它们合适的主人。在之后的绿宝石篇中，开拓之脑莉拉在城都收服了雷公并在对战中使用。
传说的大型鸟宝可梦
凤王和洛奇亚的TCG绘图
凤王和洛奇亚是初次登上游戏封面的传说的宝可梦。凤王与洛奇亚将作为整个故事的重要线索。
传说中凤王与洛奇亚分别栖息于铃铛塔和钟之塔上受人朝拜，但自从钟之塔大火后，它们因为对人类的失望而离开了圆朱市。洛奇亚从此居住于漩涡列岛的深处，被当地人称为海神。在传说中漩涡列岛便是被洛奇亚用电光将其劈成4块的。凤王则不知去向，它派出传说的三圣兽来观察人类。传说直到一天人类重新得到它的信任时，它就会回到铃铛塔上。
在游戏中，洛奇亚并没有成为第二世代故事的中心，只是被提到曾经栖息在圆朱市。但是在游戏中的漩涡列岛主角能够遇到洛奇亚。在宝可梦ＸＤ 暗之旋风 黑暗洛奇亚中，洛奇亚以无法被净化的暗黑宝可梦的身份作为故事主角登场，在之后的续作中也有着与洛奇亚有关的剧情。
在电影幻之宝可梦 洛奇亚爆诞中，洛奇亚作为阻止火之神、雷之神和冰之神暴动的海之神登场。而动画的首作的城都联盟篇中，小智一行人在漩涡列岛的冲岛也遇到了洛奇亚，并且提出了传说的宝可梦也能繁衍后代的理论，但这在游戏里是不可能实现的。
在动画中，凤王出现在了动画首作的最开头。当时可能由于凤王的设计尚未完善，全身都是金色，所以也有说法称其为异色宝可梦。但是在这之后，除了引领小智前往新的地区之外，凤王的剧情较少。
在特别篇漫画中，凤王是将年幼的小蓝和小银等人抓走的宝可梦。洛奇亚曾经在苏芳岛被小渡等人召唤，但被小黄阻止。假面男为了实现自己的野心收服了两只宝可梦，最终它们在众多宝可梦的心意下清醒过来，脱离了假面男的控制。
第三世代
超古代宝可梦
超古代宝可梦的绘图
继代表万物复苏的天空之神凤王和孕育生命的海洋之神的洛奇亚之后，第三世代出现了直接代表天空，陆地和海洋的三只传说的宝可梦：烈空坐，固拉多和盖欧卡。固拉多和盖欧卡的原型从样貌来看，像是甲龙和虎鲸，分别代表陆地和海洋。烈空坐的原型是传说中的生物飞龙，代表天空，也代表调和。相传当陆地与海洋相互碰撞之时，碧绿色的光芒将从天而降，平息海洋与陆地的愤怒。愤怒被平息后，固拉多便会沉睡于火山之底，盖欧卡会沉睡于深海之渊，而烈空坐则歇息于天空之柱。
在特别篇漫画中，海洋队和熔岩队让两只宝可梦在丰缘地区展开激战，最终在永恒的宝可梦和烈空坐的作用下得以平息。烈空坐还在Ω红宝石·α蓝宝石篇登场，对抗从宇宙而来的陨石。
在电影七夜的许愿星 基拉祈中，巴特勒本欲使用基拉祈的力量使固拉多复活，但最后实验失败，复活的只是长得像固拉多的怪物，会使用触手将东西吸取。而在精灵宝可梦特别篇绿宝石篇中铠甲男利用基拉祈的力量制造盖欧卡，制造的也只是长得像盖欧卡的怪物——“海之魔物”。
永恒的宝可梦
永恒的宝可梦的动画绘图
永恒的宝可梦是指雷吉洛克、雷吉艾斯和雷吉斯奇鲁。传说中它们由雷吉奇卡斯所分别用岩石、寒冰、钢铁模仿自己的样子而创造。三只宝可梦守候着雷吉奇卡斯的沉睡。 它们的原型来自希伯来传说中的魔像，分别象征着史前三大时代的石器时代、冰河时期和铁器时代，身体上的不明的圆形点状图案或许是它们的眼睛，这可能与盲文有关。它们在电影中最早登场于梦幻与波导的勇者 路卡利欧中的世界初始之树。
在特别篇漫画中，它们曾经被大吾等人用来控制丰缘地区的危机，后来落入了神代手中。
无限宝可梦
主页面：无限宝可梦
拉帝亚斯和拉帝欧斯
尽管至今为止没有什么关于无限宝可梦的传说出现。不过它们的出现率绝对不逊色于其它传说中宝可梦。
在游戏中，在《红宝石／蓝宝石／绿宝石》中主角只能遇到其中一只，另一只则是需要通过官方活动赠送的无限船票前往南方孤岛才能相遇。而《欧米伽红宝石／阿尔法蓝宝石》中主角在大吾的带领下来到南方孤岛可以让其中之一加入队伍，而另一只也需要通过官方活动赠送的无限船票前往南方孤岛才能相遇。并且主角可以通过无限之笛召唤他们飞上太空。
在水都的守护神 拉帝亚斯和拉帝欧斯中，他们是水都奥多马雷的守护神。
在特别篇漫画中，拉帝亚斯和拉帝欧斯是米拉特等人的朋友，后来在Ω红宝石·α蓝宝石篇也有过重要出场。拉帝亚斯可以化身成为女孩子的形态。
第四世代
湖中的传说宝可梦
湖中的传说宝可梦指的是由克希、艾姆利多、亚克诺姆。它们分别栖息在睿智湖、心齐湖和立志湖。根据传说，它们分别代表知识、情感和意志。
在动画中，艾姆利多、亚克诺姆、由克希以影子出现分别出现在出发！双叶镇到真砂镇！、激战！各自的对战！、由克希之影！，分别由小光、小智、小刚看到了它。在亚克诺姆、由克希、艾姆利多！中，它们被银河队雇佣的J捕获，小智、小光、小刚把它们释放，阻止赤日召唤出帝牙卢卡与帕路奇亚。
在特别篇漫画中，它们则分别是普兰汀娜、戴亚蒙德和帕尔试图拯救的宝可梦。
时空神话的宝可梦
神话的宝可梦是传说的宝可梦帝牙卢卡、帕路奇亚和骑拉帝纳的统称。传说中它们由阿尔宙斯所创造，从浑沌的蛋中诞生。帝牙卢卡据说是学会时间的宝可梦，被称作时间之神。当帝牙卢卡的心脏跳动时，时间就会流逝。帕路奇亚据说是学会空间的宝可梦，是操控空间的神。随着帕路奇亚的每一次呼吸，空间变得更加安定。骑拉帝纳据说是掌管反物质的宝可梦，它从毁坏的世界来到精灵宝可梦世界时，会从起源形态改变为别种形态。
帝牙卢卡和帕路奇亚居住于时空的裂缝之中，而骑拉帝纳则被驱逐于毁坏的世界之中，在那里静静地凝视着原来的世界。在电影的神之战三部曲中登场。在决战时空之塔 帝牙卢卡VS帕路奇亚VS达克莱伊中提到，传说时间与空间相遇时将会互相残*，世界将会崩坏，唯有播放时空之歌奥拉席翁才能阻止它们。
神话的宝可梦也是特别篇钻石·珍珠篇、白金篇和心金·魂银篇故事中的主要宝可梦。
席多蓝恩
传说中帝牙卢卡与帕路奇亚曾有过一次大战，战斗时迸出的碎片落下来诞生了席多蓝恩。
在特别篇漫画中，席多蓝恩是冥王在第八章捕获的宝可梦之一。
雷吉奇卡斯
据说雷吉奇卡斯是拖动了大陆的宝可梦，用特殊的冰山、岩石和熔岩制作出了永恒的宝可梦们。
在特别篇漫画中，雷吉奇卡斯加入了戴亚蒙德的队伍，昵称为“阿奇”。
克雷色利亚
克雷色利亚是梦与月的宝可梦之一，代表新月与美梦。传说在达克莱伊出现之时，克雷色利亚就会出现并驱散它的恶梦。人们只要带着克雷色利亚的新月之羽就不会做噩梦。
在特别篇漫画中，克雷色利亚是桄榔同行的宝可梦。
第五世代
道之三龙
道之三龙是捷克罗姆、莱希拉姆和酋雷姆的统称。动画中，酋雷姆能自如运用捷克罗姆和莱希拉姆的能力，被称为史上最强的龙属性宝可梦。捷克罗姆将力量借给相信理想的人；莱希拉姆将力量借给相信真实的人。捷克罗姆在电影精灵宝可梦电影中登场；莱希拉姆在电影精灵宝可梦电影中登场；酋雷姆在电影酋雷姆VS圣剑士 凯路迪欧中登场。
在特别篇漫画中，布莱克和Ｎ借助莱希拉姆和捷克罗姆展开决战。酋雷姆在黑２·白２篇开始被人所知。
圣剑士
圣剑士是勾帕路翁、代拉基翁、毕力吉翁以及幻之宝可梦凯路迪欧的统称。勾帕路翁是圣剑士中的队长，据说心是用铁做的。它们在酋雷姆VS圣剑士 凯路迪欧登场。
在特别篇漫画中，勾帕路翁、代拉基翁和毕力吉翁被黑暗三人组冰冻，并沉入海底。
传说的三云神
传说的三云神是龙卷云、雷电云和土地云的统称。
在特别篇漫画中，传说的三云神成为了等离子队的秘密武器。
第六世代
传说的气场宝可梦
传说的气场宝可梦是哲尔尼亚斯、伊裴尔塔尔和基格尔德的统称。
哲尔尼亚斯是生命宝可梦，当头上的角闪着七色光时就会分享永恒的生命，所经之处将会生出花草。伊裴尔塔尔是破坏宝可梦，闪着红色光芒时就会吸取生物的生命，化为一个茧沉睡在隐秘的地方。它们在破坏之茧与蒂安希中登场。基格尔德在Z爆炸诞生！卡洛斯的潜伏者!!首次登场。它能随意转换为五种形态：细胞、核心、10%形态、50%形态以及完全体形态。其中核心分为两种：一种为红色核心；另一种为蓝色核心。它拥有特性气场破坏，能够破坏哲尔尼亚斯和伊裴尔塔尔产生的气场。
在特别篇漫画中，哲尔尼亚斯加入了华依的队伍，昵称为“哲哲”。闪焰队干部帕琦拉控制了伊裴尔塔尔。小茂来到卡洛斯地区调查基格尔德，后来基格尔德被艾丝普莉给捕获，随后被弗拉达利控制。
第七世代
属性：空和银伴战兽
属性：空是为了要对抗究极异兽，在以太乐园的秘密实验室A以神话中流传下来的宝可梦之力量为目标而被创造出来的。创造之初的代号是Ｂ（Beast）Ｋ（Killer），它由人工设计的生物骨骼作为骨骼原型，全属性细胞作为遗传基因原型，并加载了由神奥地区水脉图书馆回收的资料开发出的ＡＲ系统，此时的暂定名为属性：满。但在进行3次原型测试后，3只个体都与ＡＲ系统发生排斥反应，开发者为其装上了用来缓和ＡＲ系统排斥反应的控制面罩，同时也使ＡＲ系统无法启动。开发者冻结所有个体，并将名字更改为属性：空。
当属性：空遇到值得信赖的同伴后，依靠自己的意志力破坏了束缚的面具，进化成为了银伴战兽，这个名字是由第一个让“属性：空”进化成这个样子的少年来取的。银伴战兽从沉重面具的束缚中得到解放，速度因此显著提升；它还可启动“ＡＲ系统”，通过存储碟来改变自己的属性。
阿罗拉岛屿守护神
守护神是指阿罗拉地区的四个岛屿中被称为守护神的四只宝可梦：卡璞・鸣鸣、卡璞・蝶蝶、卡璞・哞哞和卡璞・鳍鳍。被守护神选中的人，被称为岛屿之王或岛屿女王，负责管治阿罗拉地区的各个岛屿。
传说的宇宙宝可梦
传说的宇宙宝可梦是从究极空间里到来的宝可梦科斯莫古、科斯莫姆、索尔迦雷欧、露奈雅拉和奈克洛兹玛的统称。科斯莫古在古代时被称为星之子，由古至今只有极少数人知道它的存在，非常弱小。科斯莫姆是科斯莫古进化后的样子，在古代时被称为星之茧，阿罗拉的国王出于对它的崇拜而建造了祭坛。在祭坛上为科斯莫姆献上太阳之笛或月亮之笛所奏响的美乐，就会启动仪式让它进化为索尔迦雷欧或露奈雅拉。
传说中索尔迦雷欧和露奈雅拉从天空中的空洞里来到阿罗拉地区，赐予岛屿守护神Ｚ力量，令守护神臣服于它们。索尔迦雷欧自远古时代起，作为太阳之使者备受崇拜，古人以敬畏的心称之为“吞噬太阳之兽”。露奈雅拉自远古时代起，作为月亮之使者备受崇拜，古人以敬畏的心称之为“邀引月亮之兽”。而奈克洛兹玛拥有可以控制光的能力，光是他的能量源，性格非常粗暴，只要有人接近就会用激光进行攻击。它曾经从天空上出现，夺走了索尔迦雷欧／露奈雅拉的光，致使世界被黑暗包围。
幻之宝可梦
幻之宝可梦是指一类十分稀有的传说的宝可梦，在主系列游戏里，它们通常不能够在游玩时遇见，只有通过活动事件才能获得它们或者与它们相遇。
来源
第一世代传说的宝可梦的体系可能是建立在游戏发售时流行的基因学和克隆生物的基础之上。
第二世代传说的宝可梦的体系可能是建立在日本神话的基础之上。
第三世代及其重制版的传说的宝可梦的体系可能是建立在希伯来神话和诺斯底主义的基础之上。
第四世代的传说的宝可梦的体系可能是建立在古希腊神话与理论物理学的基础之上，同时掺杂了一些日本创世神话的元素。
第五世代传说的宝可梦的体系可能以阴阳理论为灵感，在设计上也表达出自然与人文的对立和平衡的理念。
第六世代传说的宝可梦的体系可能是建立在北欧神话的基础之上。
第七世代传说的宝可梦的体系建立在夏威夷、波利尼西亚等大洋洲原住民神话的基础之上，而究极异兽则启发自异次元生物。
细节
传说的宝可梦常见的非官方译名有传说兽、神兽。
在GTS上，除了幻之宝可梦不能进入对战设施的传说的宝可梦被称为特殊宝可梦。它们的共通点为皆作为主系列各个世代最关键的传说的宝可梦。
截止第七世代，每个世代都至少会新增一只飞行属性和一只超能力属性的传说的宝可梦。
第六世代是唯一没有新增可以进入对战设施的传说的宝可梦的世代。
截止目前为止，第一世代新增的传说的宝可梦最少，仅有5种。最多的则是第四世代（含霏欧纳）和第七世代（《究极之日／究极之月》 ），共14种。
第一世代新增不可进入对战设施的传说的宝可梦最少，仅有2只。第四世代和第七世代新增最多，有8只。
神奥地区的山梨博士曾经探讨过传说的宝可梦进化的可能性。
能够进化的传说的宝可梦则首次在阿罗拉地区出现。
精灵宝可梦特别篇白金篇把洛托姆与其他传说的宝可梦一并提及。
然而在同一集中冥王也提及了洛托姆是"一般宝可梦"。
在阿罗拉图鉴中，可以进入对战设施的传说的宝可梦和究极异兽背景为绿色，不能进入对战设施的传说的宝可梦背景为闪耀光芒的金色。
