元末到清初，通州东部江岸发生大规模坍塌。17世纪末到18世纪初，从通州余西到余东一线以南的长江中，一个个沙洲纷纷出水。18世纪中期建立海门直隶厅，此后，海门厅及其以东、以南的沙洲，逐步与通州大陆连接，这是南通成陆史上的第四次大并接。19世纪末20世纪初，现代南通的境域形成。
二、南通的行政建制
随着南通古代渔、盐业的发展，农业的振兴，南通的古代经济逐步繁荣，居民聚落随之出现，南通历史上的县级城市也逐步建立。
唐代以前南通地区以县为最高地方行政单位，五代以后曾设有路、州、直隶厅、军、监、县几种地方行政单位。如静海军、通州路、利丰监等。军，是一种带有军事性质的行政设置，体现了当年南通一带的军事地位。监，是生产性的行政设置，南通的"监"主要管理盐业生产。明清时的"州"有散州与直隶州之分。明代通州为散州，亦称属州，是府的下属单位，其地位略高于县。清代雍正以来通州为直隶州，直属布政使司，其地位与府相当。直隶厅与直隶州地位相同。
东晋安帝统治时期，南通范围内曾有宁海、临江、蒲涛、如皋等县，后又增设海安县，到周、隋时期这些县多被撤并。
