位于商丘市梁园区站前路59号，南北两个站房总建筑面积21151平方米。
商丘东站
位于商丘市商丘新区商鼎路、商杭路、南海大道、洞庭湖路围合区域，建筑面积7979平方米，车站采用线侧平站型，车站规模为2台4线。
芦庙站
位于亳州市谯城区芦庙镇，站房面积3000m²，为线侧下式车站，二台四线，采用一层候车。开站初期预计日均发送旅客1300人左右。
亳州南站
位于亳州市谯城区南部新区，全市常住人口635万人，（其中城市人口80万）商合杭铁路入皖后第一大站，总规模约86000㎡，其中站房面积15000m²，为线侧平式车站，客流高峰期可同时容纳1500人，设一座天桥一座地道，2台6线，开站初期预计日均发送旅客11000人左右。
古城东站
