秋冬临近，枸杞叶子会逐渐脱落，果子慢慢干瘪。所谓冬剪，不一定非在秋后修剪不可，待春节后至发新芽前，每一枝组去留合适的密度与方向，（每一枝节留取大约五到十个芽点）。去除弱枝病枝，因势利导。枸杞木质很脆弱，蟠扎拿弯必须掌握好曲度和力度。
入冬前进行的整形，可使枸杞翌年多结果，生长茂盛，减少病虫害，亦可呈现刚劲虬曲的寒树姿容。越冬可在室外避风向阳处或冷室内，因受花盆范围的限制，外加新栽植的根系抗寒力较弱，极易受冻，北方地区不妨置于地面或者没有暖气的室内，如不能，则用稻草、棉、保温袋一类包裹其外，使土壤不结冰即可安然。如果温度过高，会使植株提前萌发，于翌年的生长带来不利因素。保持土壤适度的水分，避免因干冻而造成植株死亡。寒风骤紧应时常给果实喷洒些温水，防止果实萎缩，延缓脱落，避免“退枝”。
枸杞虫害主要为蚜虫，若少量，可用软刷渍多菌灵等药水除去，过多则用*虫农药，但必须把控好施药浓度。
于翌春萌芽前视情修剪整理。每隔1至2年（春季）翻盆一次，盆土宜用肥沃疏松、排水良好的沙质土壤，缘于枸杞是观果植物，对磷酸钙等需求较多。新栽或移栽换盆，在其之下添加一些该类的有机肥，把植株放在无直射光处养护半个月左右，即可进行正常管理。
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