同时通过红茶菌发酵得到的细菌纤维，在未来新材料的应用上具有广阔的前景。随着纳米技术的进步，纳米细菌纤维由于其优异的特性可作为以后研究的方向。
红茶菌不仅仅是一种单纯的饮料，其中的各种抗氧化物质和抑菌物质及各种功能因子都值得我们去关注。在以后的研究中可以尝试分析和分离其中的功能性成分。该类物质不仅能起到抗氧化和抑菌的作用，对人体无毒无害，因而是一种有潜力的食品或食品添加剂。
国内现在对红茶菌的研究仍然以食品方向为主，主要针对发酵条件等进行优化，对于红茶菌在非食品领域方面如重金属吸附等环境保护方面的研究仍相对不足，同时由于菌种的不固定，各种优化在不同菌种构成的红茶菌中未必具有适用性，而且这些条件的优化都仅局限于摇瓶实验，而在发酵罐发酵方面的优化少有提及。
而国外针对红茶菌的研究已经转向红茶菌的应用方面，如运用红茶菌回收荧光废料中的稀土元素和重金属的吸附等环境保护方面。国内外对于红茶菌中的细菌纤维的研究则基本集中于其纤维纳米化和纳米化细菌纤维在医疗方面的运用。
