皮革沾到雨水，内部色素因此沉淀，这些色块便成了色斑。根据沾染液体的不同，斑点可分为水性、油性，前者以湿毛巾湿擦，就能渐渐溶解、淡化；后者建议使用含有清洁剂的溶剂用力擦拭，污垢脱落的同时，也有助于溶解油性斑点。另外，根据皮鞋材质的不同，清洁方式也有所差异：
磨面皮鞋、亮面皮鞋：
虽然油性鞋蜡能某种程度防水，但皮鞋仍可能形成斑点，如果鞋蜡脱落，更会浮现各种形状的斑点，此时建议透过让水分或清洁剂渗入皮革，才能淡化斑点。
先以清洁剂用力擦拭鞋面，清除老旧的鞋乳、鞋蜡，同时软化油性斑点；然后以温水弄湿毛巾、轻轻拧干，湿敷在有斑点的皮革上，尽可能让水分充分渗入，随着斑点软化，不用擦拭就会脱落，斑点也会跟着变淡。
湿敷后，在半*状态下，确认斑点消失后，将鞋子移至通风处晾干，并放入鞋撑。待皮鞋完全干燥，再以鞋乳和油性鞋蜡保养、擦亮。
如果是亮面皮质的皮鞋，因不易沾染污垢，相对适合雨天穿，但也因为鞋乳无法完全渗透，很难为皮革补充养分，所以不必涂抹鞋乳，以鞋蜡涂抹整个鞋体，帮助提亮、保有光泽感即可。
麂皮、天鹅绒、磨砂革，容易起毛材质的皮鞋：
像麂皮、天鹅绒、摩砂革这类起毛材质的皮鞋，清洁与保养方式与其它皮质大不相同。麂皮遇水时，水会浮在表面，建议穿前先喷上防水喷露，能带来防水斑的效果。不幸出现斑点，初步可用麂皮专用鞋刷（如金属刷或橡胶刷）清除；情况稍重的，能以砂纸将斑点磨掉，注意别太大力以免磨去皮革。
如果情况真的太严重，建议以湿布湿敷在斑点，使其慢慢软化、脱落，然后放在通风处晾干。成功除去斑点后，喷上有色防水喷雾补色，再以马毛刷整理一次毛料即可。
像麂皮、天鹅绒、摩砂革这类起毛材质的皮鞋，建议穿前先喷上防水喷露，能带来防水斑的效果。如不幸出现斑点，初步可用麂皮专用鞋刷清除。
常见状况 4：出现伤痕
皮革产生伤痕后，就无法回到原本的模样，不过仍能透过鞋乳与鞋蜡来修补，让伤痕较不明显、延缓恶化，藉此延长寿命。
完成基本清洁后，根据皮鞋颜色，以手指抹取比保养时略多的鞋乳，均匀涂在伤痕处。深色鞋使用比鞋色还深的鞋乳，浅色鞋就涂与皮鞋同色或颜色稍浅的鞋乳；上完鞋乳后，以损伤处为中心，连同外围涂抹油性鞋蜡，力道别大到将鞋乳也抹掉。鞋蜡的选色原则跟鞋乳相同。然后以丝袜揉成球形，轻拭鞋面润饰即可。
特别注意的是，以漆皮为材质的皮鞋，相对不容易沾染水与污垢，简单擦拭就能保有光泽，不过却容易产生伤痕与皱纹。清洁时，因表面有涂料，不必使用鞋乳与鞋蜡，以清洁剂与水搭配短毛布整理即可。不过漆皮容易因温度、湿度变化，而出现皱纹，久了便成为伤痕，一旦发生基本上就没救了，所以平时不用时，务必以鞋撑收纳。
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