2.生物"消化"
前面说过，蓝藻水华是池塘生态系统恶化的一种外观表象，也就是说，任何水质恶化，都有可能以蓝藻水华的形式表现出来。所以，从本质上讲，只要池塘生态系统平衡、健康，自然就不会发生任何水华了。
在高密度养殖的池塘中。水中营养盐类丰富，能促进蓝藻、铜绿微小鱼藻、螺旋藻等等大量繁殖。大千世界中万物都是相生相克的，从生物学食物链来说，如果此时专门猎食这些藻类的花白鲢、罗非鱼、鲴鱼、日本白鲫等滤食性或喜藻性鱼类没有投放或者数量放少了，则大量浮游植物特别是蓝藻会在水中老化直至死亡腐烂。因此，放养一定数量的滤食性鱼类(特别是白鲢)是根治蓝藻暴发的首选措施。
目前，蓝藻的暴发既普遍又确实忧人，对于蓝藻的处理方法，到目前为止并没有十分有效的办法，水体配养滤食性或喜藻性鱼类当然才是最好的方法。在现实中我们可见：池塘养鱼以白鲢，花鲢鱼为主养的，蓝藻就不会大量产生；主养其它鱼的，只要白鲢混养合理(一般每亩100-300尾)，一般也没有蓝藻暴发的现象。如果池塘混养有白鲢、花鲢而仍然严重爆发滋生蓝藻，证明你有可能花白鲢鱼的混养比例失调，应稍加提高白鲢的混养比例。因此，千万不要因嫌弃白鲢鱼的价值低廉而不套养。
3.生物"竞争"
蓝藻与一种或一类细菌在对生存环境上的营养元素的利用上存在竞争关系，那么我们可以泼洒有益藻菌生物制剂去与蓝藻竞争。一旦有益藻菌占了优势，蓝藻就会成为弱势种群，并且还可能会被有益藻菌分解掉，就不会产生蓝藻毒素，不会对水体和养殖动物产生负面影响。
(小球藻)
蓝藻生活在水中，受到外界环境和其它藻类的影响，如果水体中小球藻、硅藻、绿藻、隐藻等藻类多了，水体藻相均衡，蓝藻基本上就不会大量繁殖。蓝藻大量繁殖时，培植其它藻菌，其它有益藻菌一旦繁殖起来，蓝藻就会慢慢减少，直至其消失。
采用培植有益藻菌的方法比上文说的生物"消化"的效果要差得多，但只要在平时搞好水质调节和培藻育菌工作，防患于未然，也不失为一个好方法。如果不出现蓝藻大量死亡，不用给水体解毒和改底，用有益藻菌处理蓝藻，是要与蓝藻共生的竞争斗争，这是一个生物竞争的过程，需要一定的时间，见效会比较慢，变化是缓慢的、温和的。
五、化学消灭蓝藻的方法
使用*藻药剂消灭蓝藻是迫不得已的一种方法，治表不治里，可能今天消灭了它，又可能十天半月后又会复发，并且还会引起水质一系列的"动荡"应激反应，破坏水体生态系统，因此不可取。
化学消*法主要是指利用能够*藻的消*类产品，如强氯精，硫酸铜，络合铜，漂白粉，过硫酸氢钾复合盐粉或者市面上销售的蓝藻分解类产品。采用*藻剂灭藻的处理方法往往会造成蓝藻大量集中死亡，会引起鱼虾大量的不适应甚至死亡，所以原则上不提倡这样处理，在迫不得已时*藻后必须解毒，增氧，加水。
下面就使用*藻药剂消灭蓝藻的种类作一简介：
(1)蓝藻分解类药物
目前市场上出售的蓝藻分解类药物大多以"蓝藻分解精(素)"为名，说明书上主要成分大多没有注明，使用后有一定效果，购买时在详细了解后可以使用。
