1、原料来源不同。有机食品原料来自于有机农业生产体系或野生天然产品。
2、包装不同。有机产品的包装通常使用由木、竹、植物茎叶和纸等制成的可降解或可回收利用的包装材料。
3、生产标准不同。有机食品在生产和加工过程中必须严格遵循有机食品生产、采集、加工、包装、贮藏、运输标准。中必须建立严格的质量管理体系、生产过程控制体系和追踪体系，一般需要有转换期，即需要2-3年的休耕、培育，再经过检测、认证，种出来的产品才是有机食品。
能通过外观和口感能识别出有机产品吗？
有机食品就是要求在动植物生产过程中不使用化学合成的农药、化肥、生长调节剂、饲料添加剂等物质，也不能是基因工程产物，是完全遵循自然生长规律而生产的产品。
尽管一些专家和研究人员认为，有机方式生产的食品在口感和营养方面比普通食品要好得多，但目前还没有这样的指标能区分出有机食品和普通食品。至于外观，有机食品和普通食品没有明显区别，有的外观甚至还要更差一些。
有机食品与无机食品最主要的区别是概念不同，有机食品指来自有机农业生产产出的食品，无机食品是一个不存在的概念，没有无机食品这一有关食品的说法。有机食品是一种要求较严格的食品标准，在生产中不能施加额外的化学肥料，不能使用化学农药。
除了有机食品外，还有无公害食品、绿色食品、普通食品的概念，其中有机食品最为严格，完全隔绝了现代的人工合成的农业辅助化学品，绿色食品则是在生产过程中需要遵循可持续发展原则，无公害食品则是不会在生产过程中对环境产生破坏，普通食品则是指一般用于人类食用的食品。
