1.生长周期不同
生活于深海的鱼类，通常所处的海水温度也会比较低。特别是接近南北极的水域，温度都非常低。所以，深海鱼相比较于浅海鱼，大多都是生长周期比较长，生长较为缓慢一些。
2.肉质味觉感受不同
在海中深度每超过10米，每一平方厘米的面积就会有一公斤压力，换算起来，在水深1000米的地方，每平方厘米的压力就会高达100公斤以上，所以深海鱼长度所受的压力比浅海鱼类大得多。所以，通常而言，深海鱼类的肉质会更加紧实一些，不像浅海鱼的肉质吃起来那么鲜嫩而味美。
淡水鱼主要指的就是淡水养殖的鱼，深海鱼指的是生活在深海地区的鱼。
1、深海鱼中含有多种矿物质、多种维生素、多种微量元素，比淡水鱼的整体营养价值高。
但其生长的环境中，也很可能会让深海鱼误食用到各种的有害物质。而淡水鱼家饲养，又有安全的饲料来源，在污染物这方面比深海鱼好很多。
2、淡水鱼和深海鱼的味道有一些不同。
淡水鱼有一种鱼腥味，一般来说淡水鱼身上的刺都比较多，像是草鱼、鲢鱼、鲤鱼等，而深海鱼一般刺都比较少，很少有斜刺，像是黄花鱼等，海水鱼大多都有一种海腥味，淡水鱼的腥味则比较少
