一声长叹之后，平野还是将尘封在自己回忆中的往事娓娓道来。年轻的他们，坚信着战争的胜利会带来渴望已久的和平，投身帝国进行生化武器研究工作。当他们见识到自己研究出来的生化武器的可怕之处后，认识到不能将这种罪恶的武器用于战争！
极力向上级提出反对意见的近藤，被军方当成背叛者进行首次人体实验。变成怪物的近藤在*了除平野外的所有研究人员，毁了所有的人工细菌之后逃进了沼泽里面。为了防止近藤再次伤害他人，活下来的平野编造了沼泽的恐怖传说，主动承担起照顾近藤女儿的责任。
然而近藤女儿却在一场轰炸中死去，倍感愧疚的平野选择居住在沼泽盘陪伴近藤一生。地底贯穿弹的污染让近藤成为巨大化的狂爆怪兽，一番交战之后，狂暴的近藤被盖亚用光线净化了，化作光芒消失在赤红色夕阳中。
看完以后不难发现，盖亚奥特曼第39集悲伤的沼泽要素过于明显，人体实验，细菌武器，战争，很容易让观众联想到臭名昭著的731部队。不管是对没有人性丧尽天良的日本军方的刻画，还是对生化武器骇人听闻的恐怖影响的描写，无不批判了日本人不可饶恕的罪行，讽刺了军方为达目的不择手段的自食其果。
