整个质量效应3部曲的大致剧情就是玩家扮演的主角薛帕德联合银河系中的各种文明和种族联手对抗名为“收割者”的势力，作为三部曲中的第二部游戏，《质量效应2》的主线剧情就是在银河系各处奔波招募队友。并且每一位队友都会有着其专有的故事剧情，无论是主线还是支线中玩家面临的选择特别多。不像现在的很多游戏看似有很多选择其实对剧情走向和结局几乎没有影响，《质量效应2》中的每一个选择都会影响到后续队友的死活，结局的走向，甚至还会影响到《质量效应3》中的结局。
举个例子，在《质量效应2》中玩家的主要任务就是尽可能地拉拢更多的盟友来和收割者进行决战，每成功结盟一个种族就会形成一定的战斗力，在《质量效应3》中不同的战斗力就会在与收割者的最终决战中产生不同的结局。而玩家的不同选择也会导致最后的战斗力天差地别，所以在游戏中的每一个选择都得慎重，必须得代入到游戏中才能够做出正确的选择。
队友的支线剧情也是同样重要，因为这关乎到最后结局时所有队友的存活问题，如果你队友支线不怎么做，剧情中的选择也都是瞎选的话，那么游戏最终章节中会导致队友团灭只剩你1个人的结局，如果你每位队友的任务都完成，那么最后可以达成所有团队成员存活的圆满结局，队友的存活也关乎着系列最后的结局，这种剧情上可以选择的自由度相当高，和它相比，去年同样题材的RPG游戏《星空》就差得太远了。
除了剧情之外，游戏的玩法也是相当吸引人，玩家可以在银河系中自由探索，光是可以降落探索的星球就有20来个，虽然说由于当时技术的限制每个可降落的星球都只能探索一小片地方，但是那种在太空中探索的新鲜感确实实实在在给到了玩家。而且有些星球制作组也是特意安排了没有提示的支线任务，当你通过自己的探索触发了这些任务的话会有相当大的成就感。
