在《邪恶天才2》中，我们获得建造资金和资源的主要手段就是派遣手下去世界各地违法犯罪，而派遣出去的手下不会再回到老巢中，博士个人不太喜欢这个设计，如果手下可以培养训练的话，代入感应该更好一些；另外，每次执行任务的时间也比较长（半个小时以上），这导致游戏的节奏有点慢！
我们精心打造的老巢随时会被正义联盟的特工袭击，这个时候运用各种手段打败、俘虏、哄骗特工就变得很有意思。不过，《邪恶天才2》在这方面的设计缺陷很多，比如：陷阱威力太弱、手下AI可变选项太少等等。游戏似乎丢失了前作里那些核心的东西，而且整款游戏呈现出“半成品”的感觉。
另外，游戏还存在着各种让人不爽的问题：比如：主线/支线任务存在卡死的情况、赚钱只能消耗人员去执行计划/赌场基本沦为摆设、手下的智商惨不忍睹、游戏虽然减少了操作量但是换来了更多无聊的等待，等待跳钱、等待研究、等待杂工重生等等。
前面说了很多游戏不好的地方，下面来说说游戏好的地方。《邪恶天才2》画面精致、氛围烘托得不错，有恶搞的动作、有趣的台词和欢乐的人员说明，这些地方还能看到原作的影子，剩下的都需要优化调整！
