普通的电影会向观众讲述一切，优秀的电影则偏向于让观众体会一切。《只有芸知道》显然属于后者。“芸”独有的秘密究竟是什么，影片前半段就看似给出了答案：面对极光，罗芸许下了只属于自己的愿望，希望小餐馆能被毁坏，从而自己深爱的丈夫就可以减少操劳，过上重拾兴趣的生活，如果到此为止，那么影片的层次无非是寻常奉献与浅淡的夫妻情感。
但是影片末尾迎来剧情的二次反转，借罗芸父母之口道出了她的另一层秘密，她犹豫着不接受真爱的求婚是因为作为严重早产儿，对自身余下生命长度的不自信。影片的主题自此将爱情与新生对接，出现了二次升华，冯小刚的大棋还不甘停止，片末的彩蛋里，隋东风发现了罗芸埋藏在笛子里的留笔，早已逝去的妻子表达了对他走出悲痛、重拾兴趣的欣慰，到此为止，影片对爱情的渲染达到了三度高潮，夫妻情爱直接跨越了时间，联通了生离死别的世界，对双方的生命维持着永恒的影响。
纵观全片，“芸”究竟知道些什么呢，在笔者看来，是对于爱情方向如何抉择的一种自信，是对真爱之人所思所想的换位思考，是对于婚姻生活里负面因素的善意隐瞒，亦是对于生死时刻爱人感受的首位担忧……影片一边展现，一边探索。一段由真爱所孕育的婚姻，究竟会不会因为其中一人的半路离开而变质？从陈太丈夫的艺术品印章，到罗芸藏在丈夫短笛中的纸卷儿，冯小刚导演借着新西兰的旧事，给观众提供了一个善意的答案。
随着年龄的增大，真爱是否会随着时光逐渐淹没在婚姻琐事之中，当下越来越多的人对这一问题提出了疑虑。其实世界上从来没有十全十美的婚姻生活，现实世界中的“完美婚姻”，不过是一份青春的承诺背后，双方一边履行着自己的责任，一边学习着去和对方的世界融合，光阴流转，岁月将青丝漂向淡色的过程中，“爱”这个人类灵魂里最接近神性的部分，也由初生的懵懂期到达了相对稳定的成熟状态。
